壹級學科國家重點學科 （2個）
生物學、藥學
二級學科國家重點學科（8個）
免疫學、病理學與病理生理學、皮膚病與性病學、影像醫學與核醫學、婦產科學、腫瘤學、麻醉學、內科學
三級學科國家重點學科（2個）
外科學（胸心外）、外科學（骨外）
國家重點（培育）學科（1個）
外科學（普外）
國家中醫藥管理局重點學科（1個）
藥用植物學
壹級學科北京市重點學科（1個）
基礎醫學
二級學科北京市重點學科（4個）
神經病學、護理學、眼科學、流行病與衛生統計學
交叉學科北京市重點學科（1個）
轉化醫學
三級學科北京市重點學科（1個）
外科學（普外）