如果是胃神經官能癥的患者，可能出現反酸、惡心、上腹部疼痛等癥狀，如果是腸神經官能癥的患者，可能出現腹痛、腹瀉、便秘等癥狀，病情易反復，嚴重的還會影響身體其他器官，比如眼睛幹澀、皮膚灼熱等。
腸胃功能紊亂會出現厭食、體重減輕等癥狀。有很多的人出現嘔吐，患者大多數都是青春期的女性，現在有很多的年輕女性為了保持自己的體重，所以在飲食這方面調理的並不好，導致了出現病態，有壹定的現實情況。長期的如果控制自己的飲食，體重可能會減輕到原來的40~%60%左右，但是非常容易出現營養不良的問題，會導致內分泌失調，出現壹些其他疾病，腸胃功能紊亂算是比較輕的壹種情況。