細菌性發燒往往是由於身體感染細菌所導致的。出現細菌感染的時候，細菌會在人體內大量繁殖細菌的各種代謝產物和細菌產生的毒素，尤其是內毒素，可以作為外源性的致熱源，刺激人體內的白細胞，並釋放產生來白介素，進而刺激人體內的體溫調節中樞，造成體溫調定點上移。這個時候就會出現產熱增加、散熱減少的現象，而出現體溫的升高就出現發燒的癥狀。
針對細菌性感染進行抗生素的治療是十分有必要的。首先要檢查血常規以及c反應蛋白明確出現細菌性感染的情況，然後使用抗生素來進行治療。如果是不太嚴重的發燒，可以口服抗生素，比如頭孢拉定或者頭孢氨芐。此外，發燒的溫度如果比較高大於38.5度以上，建議口服布洛芬進行退熱治療。