鎘的種種特性使土壤容易遭受廣域性的汙染，且壹旦汙染，鎘容易進入大米中。因此必須加強源頭控制，包括大氣汙染和工業廢水排放的控制、采用含鎘低的磷肥、合理適量使用畜禽糞便等，降低甚至消除外源鎘對稻田土壤的汙染，這是消除外源汙染造成鎘大米的關鍵。
土壤酸化是造成稻米鎘超標的壹大原因。我國人多地少，土壤復種指數高，施肥量大，造成土壤酸化，再加上來自大氣的酸雨，含硫礦區的酸性礦水，導致土壤特別是酸雨區和含硫礦區周邊的土壤酸性現象嚴重。因此通過石灰等堿性物質改良土壤是消除鎘大米的壹個重要措施，當然石灰需要量需要科學計算，土壤pH的調節要達到6.5以上才行。
稻田的水分管理是控制稻米鎘的另壹個重要措施。理想的條件是全過程淹水，有助於將稻米中的鎘降到最低。但全過程淹水在大田生產中不現實，壹是耗水量大，慣常的水稻生長管理需要中幹排水來控制水稻分蘗和改變土壤環境，通過中幹排水過程釋放養分。日本對中低度鎘汙染的土壤通過水稻在抽穗前後三周保持田面2~3厘米的水層，防止土壤表層處於氧化狀態，從而能大幅度地降低稻米的鎘含量。對於土性很軟的稻田，這樣的水分管理會帶來機械耕作困難，對水稻在抽穗後10天保持2~3厘米的水層也能收到較好的降鎘效果。