治療原則
腦血栓應盡早治療，盡快恢復和改善腦局部缺血區供血，最大限度爭取神經細胞存活，減少腦組織損傷，降低致殘率和病死率。病情穩定後盡早進行神經功能康復訓練，促進康復；預防復發。
壹般治療
1、盡量保證患者呼吸道暢通，並註意休息。
2、幫助患者定期翻身，註意肢體位置，防止發生褥瘡，並避免感染。
3、積極治療高血壓、糖尿病、冠心病等能引起腦血栓的原發病。
康復治療
康復治療主要以高壓氧和後期的康復訓練為主，高壓氧越早做越好，安醫大臨床附屬華安腦科醫院高壓氧有40人艙。後期輔助康復訓練，如，針灸治療，按摩等功能康復訓練。
藥物治療
1、靜脈溶栓治療
靜脈溶栓是目前最主要恢復血流的措施，藥物包括重組組織型纖溶酶原激活劑（rt-PA）、尿激酶、替奈普酶。rt-PA和尿激酶是目前使用的主要溶栓藥，現認為挽救半暗帶組織時間窗為4.5h或6h內。應結合各適應癥、禁忌癥合理使用。
2、抗血小板治療
研究顯示，卒中後48小時內口服阿司匹林能顯著降低病死率或殘疾率，減少復發，僅輕度增加癥狀性顱內出血的風險。因此對於不符合靜脈溶栓適應癥且無禁忌癥的腦血栓患者，應在發病後盡早給予阿司匹林抗治療。對於不能耐受阿司匹林者，可考慮選用氯毗格雷等抗血小板治療。
3、抗凝治療
對於大多數腦血栓患者，不推薦無選擇地早期進行抗凝治療。特殊情況下溶栓後還需抗凝治療患者，應在24小時後使用抗凝劑，可用藥物包括普通肝素、低分子肝素、口服抗凝劑和凝血酶抑制劑等。
4、降纖治療
研究顯示腦血栓急性期血漿纖維蛋白原和血液粘滯度增高，降纖制劑可顯著降低血漿纖維蛋白原，並有輕度溶栓和抑制血栓形成作業。對於不適合溶栓並經過嚴格篩選的患者，特別是高纖維蛋白原血癥者，可選用降纖治療。包括降纖酶、巴曲酶、蚓激酶等降纖制劑。
5、他汀藥
發病前已經使用他汀藥物的患者繼續使用可改善預後，發病後應盡快對腦血栓形成患者使用他汀藥物開展二級預防，但其種類和強度需個體化決定。
相關藥品
重組組織型纖溶酶原激活劑（rt-PA）、尿激酶、替奈普酶、阿司匹林、氯吡格雷、普通肝素、低分子肝素、降纖酶、巴曲酶、阿托伐他汀、匹伐他汀
手術治療
1、對於大面積腦梗死有可能發生或已經發生腦疝者，應急診手術去骨瓣減壓和清除梗死組織，以挽救生命。
2、不適合溶栓治療或溶栓治療無效者，可考慮機械取栓。
治療周期
腦血栓的治療周期壹般為3~6個月，但受病情嚴重程度、治療方案、治療時機、個人體質等因素影響，可存在個體差異。
治療費用
治療費用可存在明顯個體差異，具體費用與所選的醫院、治療方案 、醫保政策等有關。