烹調燕窩的方法，最好是文火隔水燉。蒸鍋中放入清水燒開，燉碗裏放入燕窩，註入過濾幹凈的浸泡過燕窩的水，隔水文燉1小時左右。用電燉鍋隔水快燉壹個小時也可。可根據自己喜歡的口感掌握時間。時間控制在40分鐘至2個小時之間為宜。
清燉的時間由兩個因素決定。壹是取決於燕窩本身的品質，要看燕窩的厚薄、幹濕度而定，壹般是6-8小時即可，如果是血燕的話，則要花上雙倍的時間；二是取決於人的體質，為了方便吸收，體質較弱者，例如老人、病人，燉燕窩的時間要多於常規1小時，即7-9小時。