蛋白質過敏：當各種蛋白質進入人體後，體內即產生相應的抗體，倘若有相同的抗原再次進入體內，就會產生抗原抗體反應，即免疫反應。但由於某些嬰兒有先天性高過敏體質遺傳因素的影響，機體對抗原的反應異常增強，於是就會產生過敏反應，從而導致濕疹的發生。
不同的食物蛋白引起的嬰兒濕疹部位不同。如對牛奶過敏，首先從頭面部開始出現紅斑、丘疹濕疹，上面覆蓋痂皮，而後向胸背四肢蔓延。
過敏嚴重的寶寶應使用特殊的配方奶，如水解蛋白嬰兒奶粉、基本氨基酸衍生的嬰兒奶粉等。