2011年藥博會由安徽省人民政府、中國國際貿易促進委員會和中國中藥協會***同主辦，由亳州市人民政府、中國國際貿易促進委員會安徽省分會、安徽省食品藥品監督管理局、 中國北京同仁堂（集團）有限責任公司和康美藥業股份有限公司聯合承辦，得到了商務部、科技部、衛生部、國臺辦、國家體育總局、國家中醫藥管理局 、國家食品藥品監督管理局、世界中醫藥學會聯合會、中華中醫藥學會和中國醫藥保健品進出口商會的鼎力支持。
大會以“中醫藥，讓人類更健康”為主題，以“弘揚中醫藥文化，加快中醫藥產業發展，促進中醫藥造福人類”為宗旨，樹立“人文藥博、生態藥博、科技藥博、養生藥博”理念，采取政府主導、社會參與的市場化運作機制，把2011年藥博會辦成以藥為媒的招商平臺，以藥展為載體的貿易平臺，以國際化為目標的合作平臺，以中醫藥養生文化為內涵的學術平臺和“中華藥都、養生亳州”城市形象的展示平臺，推進千億元現代中藥產業基地和國家中藥現代化科技產業（安徽）基地建設，***安排經貿、學術、文化三大板塊12項活動。
經貿板塊突出展覽展示、招商推介和經貿洽談，設置了2011年國際（亳州）中醫藥展、2011年國際（亳州）藥材藥品交易洽談會暨簽約儀式和2011年中國（亳州）投資環境說明會暨項目簽約儀式等3項活動。
中醫藥展***設置了“中成藥、中藥飲片、中藥保健酒、中藥日化產品、中藥保健食品飲品、中藥消毒液殺菌劑、獸用中藥、醫療器械、藥械、健身氣功相關產品”等展區。
本屆中藥材交易會已納入商務部內貿領域支持展會，根據財政部辦公廳、商務部辦公廳《關於2011年流通領域放心肉服務體系等項目資金安排有關問題的通知》（財辦建[2011]52號）精神，對境內每個參展企業按展位費的70%進行補貼，補貼金額最高可達壹萬元。
學術板塊更具針對性，***設置了2011年中醫藥國際化發展論壇、第五屆全國知名中醫院院長論壇、中醫院藥事管理經驗交流研討會暨小包裝中藥飲片推廣使用標準化論壇和中藥調劑與合理用藥學術研討會等4項活動，屆時國內外知名中醫藥企業、中醫藥知名專家、中醫院院長、藥劑室主任將雲集藥都。
文化板塊在內容上更加豐富多彩，將舉辦華佗誕辰1884周年祭祀大典、2011年亳州第二屆中國健身氣功博覽會暨第三屆華佗五禽戲養生健身節活動、“中醫藥，讓人類更健康”文化廣場活動、開幕式暨主題晚會和閉幕式焰火晚會等5項活動。