治療嗜酸性肉芽腫的方法主要為外科手術去除病變組織。如病變位於難以手術的位置，可采用化療或放射治療（以寄生蟲卵量為依據）。化療和放療壹般適用於直徑小於2cm的病變，而更嚴重的病情可能需要通過手術切除。
對於嗜酸性肉芽腫患犬的護理與治療，需要患犬在術後保持良好的休息和飲食習慣，註意術後傷口的消毒，避免犬只猛跳以及在床上躺太久。患犬的飲食要註意低脂飲食，盡量避免給予辛辣或含高脂肪的食品。
此外，及時就診和定期就診以及以保持犬只良好的衛生、健康和營養狀態都是預防嗜酸性肉芽腫的有效措施。