1、高度不同：艾草高，艾蒿矮。艾草的生長周期長，從3月到5月是旺盛期，所以植株高大、壹般在80-250厘米之間。桿有棱，主幹直徑較粗，頸部呈淡綠色，最大直徑可以達到1.5厘米左右。
而艾蒿生長周期比較短，壹般到清明之後葉子就開始變老，所以高度相對較低，桿無棱，主幹也比較細小，莖部呈暗紅色，長勢最好的蒿草，高度也不過10厘米左右。
2、葉子不同：最簡單的方法就是看顏色，艾草的葉子是青灰色，也可以說是灰綠色。艾蒿的葉子是灰白色，會有明顯的泛白。從葉子形態來看：艾草葉片寬大肥厚，葉面平整，褶子少，背面分布有白色蛛絲狀小絨毛，葉片周邊鋸齒小而密。而艾蒿葉片細長單薄，葉面褶多，葉片周圍紋路呈鋸齒狀，紋路較深。
3、氣味不同；兩種植物都帶有香味，但是艾香程度不同。艾草的香味偏濃烈，有點像清涼油的味道。而艾草的香味偏淡壹些，就是普通的青草香，有時候還會帶有淡淡的微臭味兒。