1、意思不同：分子篩層析又稱為凝膠過濾層析或體積排阻層析，離子交換層析離子 交換層析是用離子交換劑。
2、原理不同：分子篩層析是利用具有網狀結構凝膠的分子篩作用，離子交換層析是在生物大分子提純中得到最廣泛應用的方法之壹。