南京博物院占地面積1.3萬余平方米，具有“壹院六館”格局，即歷史博物館、專題展廳、數字博物館、美術館、非遺博物館、民國博物館。此外，全院還有考古研究所、文物保護研究所、古建築研究所、展覽藝術研究所、非物質遺產保護研究所、古代藝術研究所六個研究部門，是中國博物館唯壹的國家級民俗學研究機構。
截止2010，南京博物院各類藏品42萬余件(套)，居全國前三，從舊石器時代至今；既有全國性的，也有地域性的；這裏不僅有宮廷傳世，也有考古發掘，還有壹部分來自社會收藏和捐贈，都是歷代名作，都是引起國內外學術界關註的珍品。青銅、玉器、陶瓷、金銀器皿、竹木牛角、漆器、絲繡、字畫、印章、碑刻、雕像壹應俱全，每個品種都有自己的歷史系列。
南博的藏品壹部分來自中央博物館籌備處，另壹部分來自建國後的考古發掘、收藏、收購、捐贈、接收和交流。
收藏品從舊石器時代到現在，包括石器、陶器、玉器、青銅器、瓷器、字畫、刺繡、竹木牙雕、民俗和當代藝術品等。
2007年，經過專家評選和公眾投票，* * *授予18件南京博物館“鎮館之寶”:
鎮宅之寶——金獸
這件西漢的金獸是在1982的正月初七。盱眙縣馬湖店村農民把水渠挖完整後，發現它高10.2厘米，長16厘米，寬17.8厘米，重9100克，含金量99%。它又空又厚。
禦窯之寶——釉中紅古寒三友紋梅瓶
明洪武釉紅冷三友紋梅花瓶為阿明瓷，南京市江寧區東山橋香龍山明墓1957年3月出土。
作為國寶級文物，是唯壹保存下來的洪武釉裏紅帶蓋梅瓶。這個梅花花瓶造型美觀，保存完好。老寒三友指的是松樹、青竹、梅花三種常綠植物，象征著高貴的誌向。
天上的寶——雕刻人物、鳥獸的玉飾
昆山市昭陵山遺址77號墓1991出土了雕刻的人、鳥、獸玉器。昭陵山位於昆山市張浦鎮西南，屬於長江三角洲太湖水鄉新石器時代遺址。
這件裝飾品出土時，放在墓主人右腳下壹塊石碑的圓孔裏。從朱紅色、霰上部的捆綁痕跡和現場留下的朱紅圖案痕跡來看，霰原是壹柄。霰彈作為壹種由武器演變而來的儀式器具，顯示了墓主人生前所擁有的軍事權威。
雕刻的人、鳥和動物的玉飾應該是霰上的附加飾物，具有極高的歷史價值和技術價值。它是我國出土時代最早的人、鳥、獸雕刻玉飾，是良渚先民與神靈相通、彰顯權威的神秘象征。
珍貴的寶物——金蟬玉葉
1954年，在蘇州五峰山吳大夫明代弘治年間進士張安萬家族墓地14號的發掘過程中，考古人員驚奇地發現了這塊金蟬玉葉，出土的正是墓主人的頭部。同時出土了兩枚嵌寶玉花的銀幣和四枚金銀，證明此物為貴族女子頭上的發簪。
壹只閃著金光的神形蟬站在玉葉上。它身體向上傾斜，翅膀微張，嘴巴微張，蟬鳴左右。玉葉是新疆和田羊脂制成的白玉。葉子打磨薄凹弧形，分成八瓣。構思巧妙，制作精美，妙趣橫生，令人嘆為觀止，是不可多得的工藝珍品。
奇跡般的寶藏——青瓷獸雕像
西晉青瓷獸像於1976在宜興周處家族墓冢出土。神獸雕像略呈梨形，肩腹兩側各有三條橫線，上小下大。作品呈之字形排列，平底微凹。這種青瓷獸體大，神態驚人，紋飾豐富，造型獨特，具有西晉瓷器的典型特征。這是中國最早的帶有銘文的瓷器之壹。
保護之寶——銀線玉衣
國內僅發現壹件銀色玉衣，出土於1970徐州東漢王鵬程後裔公劉墓。玉衣長1.70米，玉片2600余片，銀線約800克，形制與金縷玉衣相似。這是第壹件經過考古發掘、科學修復、保存完好的漢代玉衣。
祭祀之寶——人面獸面玉琮
人面獸面的玉琮是新石器時代的玉器，由透閃石軟玉制成，呈乳白色，帶綠色和赭紅色條紋。形狀是壹個外圓內圓的短方柱體。這個洞是從兩邊鉆的，打磨得很光滑。
這也是新石器時代良渚文化精湛玉雕技術的傑作，是良渚人原始宗教信仰最鮮明的標誌。
真知灼見之寶——鍍金喇嘛塔
20世紀50年代，牛首山紅覺寺塔地宮出土了壹座鍍金的藏式佛塔。這是明代佛教工藝的傑作，也是中國唯壹出土的“迷妳”鍍金喇嘛塔。
這座鍍金的喇嘛塔非常精美，喇嘛塔周圍有獸角佛像、瓷罐、玉瓶等等。塔內有四個壺門，包括釋迦牟尼和韋陀的佛像，上面有輪子、十三天、寶蓋和朱寶。塔內住友臺上排列著壹組佛像。住友裏藏著珍珠、寶石、水晶、瑪瑙、玉石、骨灰等東西。整座鎏金寶塔置於須彌山形狀的紅砂巖雕成的基座上，四面雕有胡人獻寶、雙獅戲球、雙鹿戲龍過浪等圖案。塔座下刻著:“金陵牛首山鴻覺寺，常滿供品”，背面是“大佛弟子、禦監太監西門李福善”。
水墨之寶——徐渭《雜花圖冊》
《雜花》是明代傑出的畫家、書法家、文學戲劇家徐渭創作的書畫作品。是中國古代寫意花鳥畫的代表作，無愧於“天下第壹徐青藤”的美譽。
這幅畫卷有十多米長。徐渭以酣暢淋漓的筆法和氣勢磅礴的氣勢，運用焦墨、潑墨、積墨等筆法和技法，生動地展示了牡丹、石榴、荷花、梧桐、菊花、南瓜、扁豆、紫薇、紫藤、車前草、梅花、蘭花、竹子等13種花果。
光之寶藏-錯銀青銅公牛燈
撮銀銅牛燈是壹件東漢青銅器，於1980年在江蘇省邗江縣甘泉2號東漢墓出土。漢代青銅燈中，實用性、科技性和藝術性完美結合的頂級作品，其環保意識和設計都領先西方國家1000多年。
銅牛燈由燈頭、燈座、煙管三部分組成。燈座是壹頭牛，低著頭站著，兩角翹著。牛的肚子是中空的，它帶著壹個圓形的燈盤。燈板的壹側設有扁平手柄，便於轉動燈板。燈板上裝飾有兩個可以靈活轉動的燈罩，其中壹個燈罩壹會兒鏤空菱形斜格圖案，起到散熱、防風、調光的作用。
長壽之寶——壽山福海青花瓷爐
明宣德壽山青花福文海瓷爐是壹件南遷文物。是明代宣德禦窯瓷器的巔峰之作，也是同類中唯壹品相較好的。
青花壽山福海紋爐上雖然沒有官窯錢，但它不僅是明代宣德朝的官窯瓷器，也是官窯瓷器中的重要器物。爐高58厘米，形似青銅鼎。它不同於壹般的青花器，是青花，即以青花為地，白釉代表波浪。
強烈的青花發色、綠料的略散之美、仿青銅鼎、看似溢滿的波浪結合在壹起，使青花爐具有壹種驚心動魄的藝術魅力，令觀者動容。完整的宣德青花壽山福海紋爐僅存壹兩件，足以見其珍貴。
慈航之寶——金觀音菩薩像
這尊佛像由高純度黃金制成，高88厘米，佛身和蓮座裝飾豪華，鑲嵌珍珠和寶石，盡顯皇家風範。應該是清代鼎盛時期宮廷的能工巧匠所制，代表了清代宮廷雕塑技術的最高水平。
地圖的寶藏——利瑪竇偉大的世界地理圖
《大通用地理圖》是我國現存最早的世界地圖，最早出現美洲地圖。作者是太仆寺邵青李之藻。這張地圖非常詳細地描繪了中國的地理。李之藻補充了很多關於中國的地理信息，這些信息是其他國家無法描述的，對於中國的省份和重要城市都有詳細的註解。地圖還描繪了中國的主要山川，如黃河、長江等，詳細顯示了它的發源地和省份。此外，還提到了世界著名的河流，如幼發拉底河、尼羅河、伏爾加河和印度河。
文房之寶——鍍金鑲嵌動物形銅盒硯
1970，徐州土山漢墓出土壹件動物造型鑲金銅盒硯。墓主人是東漢某代彭城王。書房中罕見的實用硯，構思獨特，工藝精湛，代表了漢代制硯技術的最高成就。
銅盒硯長25厘米，寬14.8厘米，高10.2厘米。銅盒硯的整體造型看起來像壹只癩蛤蟆，頭上有角，身上有翅膀，瞪著牙齒，四肢蹲伏。在當時它是壹種吉祥的動物。硯臺包金，鑲嵌紅珊瑚、青金石、綠松石。
權力與信任的寶藏——廣靈王茜金印
1981年，江蘇邗江甘泉山2號東漢廣陵王墓出土唯壹壹件漢代劉姓王金銀。它與滇王和奴隸王銀的印章是姊妹印，具有極高的歷史和藝術價值。
印章由高純度黃金制成，閃閃發光，重122.87克。印刷面長2.375厘米，寬2.372厘米。烏龜紐扣，紐扣高度2.121厘米，表高0.945厘米。其龜扣精美，裝飾精美，篆刻“廣陵王茜”篆書。布局密集，直中帶彎，流暢和諧，堅挺飽滿。全印設計精美，制作工整，是中印精品。
刺繡之寶——沈壽刺繡《耶穌像》
耶穌像是民國刺繡，是民族繡工沈壽的作品。這幅作品取材於文藝復興後期意大利畫家奇特的油畫《耶穌肖像》。它創造性地使用了虛擬針、旋轉針等新針法，並根據人物皮膚肌理的需要和油畫明暗層次的變化，精心挑選了100多種自行染色的絲線，將這幅耶穌畫像繡得惟妙惟肖。
自然之寶——錯金銀重繞銅鍋
1982二月10在盱眙姚莊地窖出土。它是贏得戰國霸主地位的青銅重器，匯聚了中國古代諸樊公益的成果。它非常有價值。
銅壺上有三處銘文，分別位於口部、圈足內側和圈足外側。沈金纏繞青銅壺是現存唯壹能結合先秦金屬技術成果，反映重大歷史事件，體現最高水平的泥塑鑄造技術的青銅器。
畫像之寶——竹林七賢磚畫
整幅磚畫長約4.8米，高0.8米。它出土於南京西善橋的壹座南朝墓中。這是中國最早和保存最好的大型人物的磚畫像。它是南朝帝王陵墓的裝飾壁畫，是20世紀中國100項考古發現之壹。
磚畫由200
它由幾塊古墓磚組成，分為兩塊，壹塊為嵇康、阮籍、單濤、王戎，壹塊為湘繡、劉玲、阮鹹、容奇。人物隔著銀杏、松樹、垂柳。八個人都坐在地板上，但每個人都表現出最能反映他們個性的姿態。士紳知識分子的理想人格在這塊畫像磚上得到了充分的表現。