有靈芝、土茯苓等各種珍稀藥用植物標本。介紹了中國八個地區的代表性藥用植物種類、貴州主要藥用植物、珍稀瀕危藥用植物等。展示了150余種的葉脯、脯青、泡制、藥用標本。
在藥用動物和礦物資源部門，有100多種我國常用的藥用動物和礦物標本。珍貴的動物藥材有穿山甲、梅花鹿、眼鏡蛇等。珍貴的藥用礦物有雌黃、雄黃和朱砂。
貴州民族藥資源處介紹了我省民族藥的種類、產地和功效。主要展示貴州民族醫藥，如苗族、布依族、侗族、水族、仡佬族等民族的藥用標本和壹些民族醫療器械。
貴州共有中草藥資源4802種，其中藥用植物4419種，藥用動物301種，藥用礦物82種。特有藥用植物80種，珍稀瀕危藥用植物97種。
在貴陽藥材博物館，遊客可以與貴州眾多地道藥材“零距離”。我省著名的道地藥材有天麻、杜仲、吳茱萸、淫羊藿、天冬、朱砂、白芨、貴州黨參等。珍貴藥用植物有竹節人參、鐵皮石斛、紅豆杉、中國紅豆杉。南方紅豆杉、貴州八角蓮、絞股藍、昆明蘋果等。
貴州產中藥產品120余種在貴州中藥產業館展示。
在中醫文化館內，除了展示針灸器械和中藥加工工具外，還設置了壹盞伊光，為名老中醫提供參觀服務。
在青少年科普互動館，結合標本制作，提供蠟葉標本、密封標本、立體藝術標本制作指導。遊客自己做的樣品也可以作為紀念品帶走。
在醫學數字信息中心，還通過網絡信息管理手段搭建了數字信息平臺，可用於查詢館藏展品信息和貴州中醫藥產業化信息。