事實上，每壹個熱衷於中醫研究的工作者都在認真思考:如何研究中醫理論？我們不能取得突破性成果和進步的原因是什麽？怎樣才能取得突破性的成果和進步？因此，筆者擬從“突破性成果”入手，逐步闡述中醫理論研究的方向。從以上對中醫基礎理論研究的評價不難看出，“取得突破性成果”是中醫理論研究最迫切、最不明確的美好願望。之所以說“不知道”，是因為“突破性成就”就像孩子經常想要的“好吃的東西”，個體差異非常大。很難說對他們對癥下藥，結果就像中醫的療效壹樣難以被認可。目標決定策略，所以在確立中醫理論的研究方向之前，首先要明確中醫理論研究的目標，從而確立壹個公認的“突破性成果”。
中醫理論研究的目標眾說紛紜，有壹個研究成果不容忽視。65438-0999，科技部、國家中醫藥管理局聯合開展“現代中醫藥科技發展戰略研究”軟課題研究。來自全國各地的100多位專家學者參加了10多場研討會，分析了當今醫學領域面臨的問題和挑戰，提出了21世紀中葉中醫藥現代化發展戰略的指導思想和目標。其中，2001至2015，中醫基礎理論研究分兩個階段:(1)2001至2005的階段目標是“中醫基礎理論的繼承與創新”。系統梳理中醫證候、藏象、經絡、治則、方藥、基礎理論，深入挖掘研究，把握其理論精髓，揭示其深刻內涵，強化其對疾病防治的指導作用。在統壹專業術語、明確概念內涵、明確理論層次的基礎上，運用現代科學理論和方法，探索其科學基礎，創造新的理論，發展和創新中醫基礎理論，豐富現代生命科學的內容和研究領域。“⑵2006-2015期間的目標是完善現代中醫理論體系。中醫學必須突破原有的框架，通過繼承、移植和創新，充分闡明理論的科學內涵，從而在理論和實踐上進行更新和完善，初步從經典完善為現代的中醫理論體系。並且隨著社會醫療的需要和疾病譜、醫學模式、生態環境的變化，中醫會從大量新的事實和經驗的積累中總結升華，產生新的理論，實現對傳統的超越。”本研究初稿經過數十位兩院院士、名老中醫專家學者和重點中醫藥院校、研究所的審閱、修改和評審。2001年5月通過專家組驗收，給予高度評價。可見研究結果的科學性和權威性是毋庸置疑的。
總之，建立新的理論，創新中醫基礎理論，突破原有框架，完善成為現代中醫基礎理論體系，是中醫基礎理論研究的近期目標。換句話說，現代中醫理論體系的建立，可以說是中醫理論突破性研究成果的最終體現。現代中醫理論體系的特點是決定當前中醫理論研究是否有“突破”的標準。在現代中醫理論體系還在爭論，大家衡量標準不統壹的時候，壹味追求“突破”是急功近利的表現，浪費財力，毫無意義。只有明確方向，沿著這個方向紮實工作，才能實現真正的“突破”。
中醫理論體系(相對於現代中醫理論體系)已有全面闡述，現存最早的中醫文獻是《黃帝內經》。《內經》反映了中醫學的理論原理和學術思想，為中醫學的發展奠定了基礎。《內經》的理論體系包括陰陽學說、五行學說、藏象學說、經絡學說、病因病機學說、病證、診斷方法、治療原則、養生和運氣學說。中醫發展史上的許多名醫、醫派，就其學術思想和傳承而言，基本上都是從《內經》的理論體系發展而來的，所以把《內經》視為“醫家之宗”。那麽什麽是“現代中醫理論體系”呢？從字面上看，對“現代性”的理解是理解現代中醫理論體系的壹把鑰匙。漢語詞典中的“現代”壹詞指的是“現在的時代(中國指的是1919-現在)”。由於中醫理論體系的研究至今沒有突破，所以現在的中醫理論體系並不叫“現代中醫理論體系”，所以這絕對不是現代中醫理論體系中“現代”的含義。相對於泛指西醫的“現代醫學”，現代中醫的理論體系應該是現代中醫理論體系，因為“現代化”的含義是“使之具有現代先進科學技術水平”，即建立具有現代先進科學技術水平的中醫理論體系。這樣的理論體系會有什麽特點，與現行的中醫理論體系有什麽區別和聯系，用什麽術語來闡述其理論，用什麽標準來衡量其科學技術的先進程度...以此類推，對“現代中醫藥理論體系”的描述和說明越詳細，宏偉的藍圖就會展現在我們面前，中醫藥理論的發展就會有明確的目標，中醫藥理論的研究工作不僅不會失去重心，還會更有動力。“現代中醫理論體系”要通過“突破原有框架”來建立，那麽什麽是中醫的“原有框架”也是要研究的課題之壹。如果妳不知道老框框和死框框在哪裏，妳就不會有針對性，更不用說突破，就是妳“認識自己”之後才能“突破”。建國以來，中醫基礎理論研究領域存在的突出問題主要表現為:中醫經典文獻中理論和觀點的整理和研究基本處於分散、自發的狀態，沒有統壹的規劃；對中醫基礎理論的學術內涵和內在科學規律缺乏深入的探索和系統的研究，未能按照科學範式進行學科建設，中醫基礎理論缺乏規範化，造成了內涵模糊、概念不清、解釋不壹等缺點，因此中醫基礎理論研究的首要任務是深化中醫基礎理論的學術內涵，從而提升中醫基礎理論的整體學術水平。
另外，需要研究的是中醫原有的框架裏還剩下什麽？保存到什麽程度，現代中醫的既定理論體系還能叫中醫理論嗎？也就是繼承什麽。在這壹點上，目前的理解是，只要堅持中醫特色，無論采用什麽理論、方法和技術來研究和發展中醫，都會促進中醫學術的發展。換句話說，中醫傳承最基本的要求是保留中醫特色。中醫有什麽特點？中醫理論體系有什麽特點？在中醫理論研究中，這些問題歸根結底是對中醫理論體系的認識和評價。只有在全面深刻理解中醫理論體系的基礎上，進行客觀的、非學術價值導向的評價，才能準確概括中醫理論體系的特點。
更難的問題是，對於壹些中醫理論體系與現代科學格格不入的特點，我們會怎麽處理？比如，有學者指出，中醫原有的理論體系在很多方面暴露出缺陷和不足，甚至嚴重滯後於中醫的發展。其表現之壹是哲學指導思想和認識方法上的缺陷。源於古代哲學的陰陽五行學說構成了中醫基礎理論的框架，隨著其自身缺陷的暴露，其指導意義受到質疑。另壹位學者指出:“在基礎理論方面，中醫的特點是以臟腑經絡學說、精氣學說、天人相應學說為基礎”。總之，“目前中醫理論面臨的危機與中醫理論本身的壹些特點密切相關，當然也與人類科學的發展，特別是現代醫學對中醫的影響和滲透有關。但後者在危機中只起到觸發作用。”因此，建立具有中醫特色的、與現代科學相統壹的新理論體系十分重要。在研究中醫基礎理論精髓的基礎上，要研究如何正確處理中醫特色與現代科學的關系。中醫的第三種哲學觀:相似觀(分形觀)。
中醫的第二哲學觀——辯證觀
第壹種哲學觀——陰陽分形集、五行分形集、經絡分維的整體觀