第壹，技術問題。因為日本開發利用氫能比較早，大部分專利都在日本手裏，所以其他國家在開發的時候會面臨很多技術壁壘和問題，這些都是其他國家不願意面對的。
第二，安全問題。雖然現在儲氫和設備效率很高，但是目前技術上無法解決的問題是儲氫設備遇到高溫或碰撞後的泄漏和氫氣爆炸。
第三，配套基礎設施的問題。目前加氫站與普通加油站相比，投資比較大，還面臨著運輸氫氣和加氫配套設施設備的問題。
第四，還是成本問題。以上三個因素造成了制氫、儲氫、運氫、加氫及配套設備成本高，與其他新能源相比沒有優勢。
相比之下，中國擁有巨大的水電資源、沙漠資源(也可以轉化為風能和太陽能資源)和UHV輸電技術。而且充電設備的成本也便宜很多，方便很多。所以氫燃料電池只是實驗發展方向的壹部分，光伏、風電、鋰電池等新能源已經成為我國主要的發展主流。