頭皮屑大多與真菌有關。
頭皮屑由頭皮角質層中的細胞組成。正常情況下，頭皮表皮下基底層的細胞會不斷繁殖並向表面推出，當這些細胞成熟成為角質層時，就會脫落。壹般來說，頭皮角質細胞脫落需要28天左右。在頭皮上，還有壹種常見的真菌群叫做馬拉色菌，以頭皮分泌的皮脂為食。如果馬拉色菌繁殖異常，數量超過正常水平，會加速表皮的新陳代謝，角質細胞的脫落過程會壓縮到7~21天。表皮細胞會大群脫落，這就是肉眼可見的頭皮屑。此外，馬拉色菌會破壞頭皮角質細胞和細胞間脂質層的緊密結構，使頭皮容易發癢、敏感。
頭皮癢的因素很多。
頭皮瘙癢通常是壹個綜合因素，如真菌感染(皮膚癬菌)、環境影響、氣候變化、精神緊張、染發或洗發產品不當等等。頭發油膩和頭皮瘙癢會互相影響。頭發油膩可形成真菌感染(如皮膚癬菌)的適宜生長環境，真菌的繁殖進壹步導致頭皮瘙癢和頭皮屑。