中醫理論體系的形成和建立經歷了壹個漫長的歷史時期。戰國以來，急劇的社會變革和學術流派為醫學理論體系的形成創造了有利的社會文化氛圍。此時，古代醫生也加速了對人體奧秘和人與自然關系的探討，試圖將醫學經驗上升為理論。他們在醫學實踐和解剖成果的基礎上，吸收了諸子百家的精華，創立了藏象、經絡、氣血、津液、精神等學說，在探討人與自然關系的過程中創造了六淫致病學說。同時將古代哲學中的氣、陰、陽、五行理論引入醫學領域，作為解釋人體生理病理、指導疾病診斷和預防的方法論。中醫理論體系就是在這裏建立起來的。
戰國至秦漢時期是中醫學理論體系的形成時期。這壹時期問世的《黃帝內經》、《難經》、《傷寒論》、《神農本草經》等醫學經典，標誌著中醫理論體系的建立，即理、法、方、藥體系的基本形成。