根據中醫的生理病理系統理論，
中醫和西醫在整體上屬於不同層面的矛盾統壹關系，即雙方的研究水平不盡相同。中醫可以在自己的理論框架內融合西醫，但西醫只能是中醫的補充，而不能代替中醫，因為中醫比西醫處於更高的層次！
西醫研究的對象只是人體。也就是說，西醫無論是從組織、器官或系統的宏觀角度研究人體的生理、病理或藥理，還是從細胞分子或量子基因的微觀角度研究，都沒有超出人體的具體視野。雖然借助現代科學，西醫的發展是好的，但是人並不是生活在真空中，而是人體以自己固有的方式適應環境，與疾病和邪惡作鬥爭。比如人在什麽生理環境下容易生病？筆者不排除西醫也可以通過壹系列特殊的設備篩選出壹部分，但更多的時候，這些設備檢測不出來。而改良後的中醫，比如利用中醫生理病理系統提供的途徑和方法，可能不需要任何設備就能準確判斷。那麽，中醫的這些優勢主要基於什麽呢？
中醫的研究對象不僅僅是人體，還包括人體在其生存環境中的綜合評價，即人與自然的對應關系，以及如何達到“天人合壹”。所以中醫的理論水平比西醫好。