1998年12月28日，健之佳春苑店正式開業，標誌著健之佳健康醫藥連鎖事業在昆明的正式啟動。
1999年2月9日健之佳與全球最大零售商沃爾瑪合作開設健之佳沃爾瑪分店。
2001年4月1日健之佳人民東路店被定為昆明市首批醫保定點藥店。
2001年6月健之佳22家分店全部被昆明市衛生局確定為首批藥品分類管理試點單位。
2001年9月30日健之佳第30家分店新聞路店開業，標誌著健之佳已發展成為昆明市規模最大的醫藥零售藥店之壹。
2002年12月健之佳被昆明市政府評為“物價計量信得過單位”。
2002年12月28日健之佳門店總數突破50家，當年實現銷售7000萬，上繳稅金232萬，實現了企業發展的歷史性飛躍。
2003年9月壹次性通過質量安全現場認證
2004年3月12日，健之佳又壹品牌名店博仁堂隆重開業。
2004年4月1日健之佳正式全面托管雲南省郵電醫院醫房，邁出了昆明醫藥流通領域改革的第壹步。
2004年5月健之佳被評為第七屆昆明市優秀企業
2004年5月，健之佳診所開業，標誌著健之佳醫療專業連鎖機構正式成立。
2004年5月底，健之佳門店已達95家，遍布昆明大街小巷，日益成為廣大市民私人的家庭醫生和健康顧問。
2004年6月，健之佳***青團委員會成立。
2004年9月，健之佳在曲靖開設了曲靖麒麟花園分店，藥店總數突破了100家
2004年10月，健之佳被盤龍區人民政府授予“守合同重信用企業”榮譽稱號。
2004年11月，健之佳被雲南省消費者協會授予“第二屆工商誠信單位”榮譽稱號。
2004年12月，“健之佳”商標被雲南省工商行政管理局認定為在“中西成藥、中藥材”商品使用上的“雲南省著名商標”。
2004年12月，健之佳被昆明市盤龍區企業聯合會、昆明市盤龍區企業家協會列為團體會。
2004年，健之佳實現營業額2億多元，上繳國家稅收500多萬元。
2005年2月，健之佳被尋甸縣政府授予“幫扶動真情，愛心獻教育”光榮稱號。
2005年3月，健之佳被中國醫藥商業協會連鎖藥店分會列為中國醫藥商業協會連鎖藥店分會會員。
2005年3月，健之佳在生活新報與雲南省企業家協會組織的十佳雇主評選活動中，被評為：“2005雲南十佳雇主”。
2005年5月，健之佳被省市殘聯授予“安置殘疾人就業‘十佳’愛心單位”榮譽證書。
2005年8月，健之佳在昆明市消費者協會組織開展的2005年度創建“消費者滿意企業”評選認定活動中,榮獲“消費者滿意企業”稱號。
2005年8月，健之佳被中國藥店雜誌評選為“中國藥店50強企業”。
2005年8月，健之佳成為昆明市農村藥品“兩網”建設供應企業。
2005年9月，健之佳被盤龍區評為“盤龍區優秀企業”。
2005年9月，健之佳第壹家藥妝店開業，這在雲南乃至整個西南地區都屬首創。
2005年12月，健之佳在昆明市農村藥品“兩網”建設中成績突出，被授予“昆明市農村藥品‘兩網’建設優秀供應企業”稱號。
2006的4月，健之佳在2006年中國連鎖藥店排行榜（銷售額）排各38位、在2006年中國連鎖藥店排行榜（分店數量）直營店排各20位。
2006年4月，健之佳被盤龍區人民政府授予“2006年度納稅大戶”。
2006年4月，健之佳體檢中心開業，體檢設備最先進，自動化程度最高。
2006年5月，健之佳被評為雲南省執業藥師協會理事單位。
2006年5月，在《中國藥店》雜誌 “中國藥店50強” 評選活動中，健之佳以銷售額名列中國藥店36強。
2006年5月，健之佳三家門店順利通過了GPP評議，是全國第18、19、20家，也是雲南省首次通過GPP評議的藥店。同時在2005～2006年度推動自我藥療各項工作中，表現突出，成績顯著，被評為自我藥療教育工作先進單位。
2006年5月，健之佳榮獲2006年國際戒煙競賽中國雲南分賽區特別貢獻獎。
2006年8月，健之佳實現與四川福利大藥房的合作，正式進入成都市場發展，標誌著健之佳正式進入省外市場發展。
2006年8月，健之佳在福特·福克斯杯第十二屆都市時報足球擂臺賽中取得第九名，獲得2007年都市時報足球擂臺賽甲級隊參賽資格。
2006年8月，2005～2006年度推動自我藥療各項工作中，健之佳表現突出，成績顯著，被中國非處方藥物協會評為自我藥療教育工作先進單位。
2006年8月，健之佳向雲南省紅十字會捐贈價值人民幣482200的保健食品，（用於紅河及曲靖群眾的健康保健）。
2006年10月，健之佳在2004~2005年度“守合同、重信用”活動中，成績突出，由盤龍區人民政府頒發榮譽證書。
2006年11月，健之佳在昆明市區的零售網點突破150家，成為昆明市最大的醫藥零售連鎖企業。
2006年12月，健之佳在全年銷售工作中業績突出，榮獲北京同仁堂科技發展股份有限公司“飛躍2006獎”稱號。
2006年12月，健之佳在全年銷售工作中業績突出，特授予北京同仁堂科技發展股份有限公司“品種開拓獎”稱號。
2006年12月26日，“健之佳”在“領袖雲南·品牌總評榜”評選中，經百萬公眾投票和專家評審，獲得“領袖雲南·十大卓越品牌”稱號。
2006年12月，公司在捐贈活動中，被祿勸彜族苗族自治縣教育局、祿勸彜族苗族自治縣防震減災局授予“捐資助學、功在千秋的獎牌”。
2006年12月，健之佳在2004年至2005年度“守合同、重信用”活動中，成績突出，連續六年被昆明市盤龍區政府評為“守合同、重信用”企業。
2007年1月，健之佳被太極集團有限公司評為“戰略合作連鎖公司”。
2007年1月8日，健之佳被揚州市三藥制有限公司及昆明天福堂藥業有限公司授予“經銷揚州市三藥制藥有限公司‘恬倩’2006年度最佳合作夥伴”。
2007年3月12日，健之佳已正式被中國企業聯合會選入“中國優秀企業數據庫”。
2007年4月，健之佳被盤龍區人民政府授予“2006年度納稅大戶”。
2007年5月，健之佳被中***昆明市盤龍區委員會昆明市盤龍區人民政府評為“2006年度至2008年度文明單位”。
2007年5月，健之佳被昆明市總工會、昆明市勞動和社會保障局等部門授予“2007年5月~2010年5月昆明市勞動關系和諧企業”。
2007年，健之佳被昆明市稅務局評選為2004-2005年度納稅信用等級A級企業，並榮獲雲南省昆明市國家稅務局、地方稅務局頒發的《納稅信用等級A級證書》。
2007年6月，健之佳在雲南省民營科技企業雙優評選中，榮獲第二屆“雲南省優秀民營科技企業獎”。
2007年7月，健之佳當選昆明市連鎖經營會會長單位。
2007年7月，健之佳在雲南省內直營連鎖藥店突破300家，覆蓋曲靖、玉溪、開遠、文山、瀘西、蒙自、個舊、大理、保山、普洱、麗江、楚雄等雲南省各地州。
2007年8月，健之佳被中華全國工商業聯合會、中國民營科技實業家協會評為07年“中國優秀民營科技企業光榮稱號”。
2007年8月，健之佳在2006~2007年度推動自我藥療教育各項工作中，表現突出，成績顯著，被中國非處方藥物協會評為“自我藥療教育先進單位”。
2007年8月，健之佳被昆明市消費者協會評為2007年度消費者滿意企業。
2007年8月，健之佳獲評“2006年度中國連鎖藥店五十強”。
2007年8月，健之佳再次躋身2006年度中國連鎖藥店50強。
2007年9月，健之佳在2007年度創建“消費者滿意企業”活動中，被昆明市工商聯評為“消費者滿意企業”稱號。
2007年9月5日~6日，在中國非處方藥物協會舉辦的“第五屆中國自我藥療年會”上，健之佳獲得2006~2007年度自我藥療先進單位榮譽稱號。
2007年10月，健之佳榮獲（2006-2007）“盤龍區第二屆優秀企業”稱號。
2007年11月，“健之佳”商標被雲南省工商行政管理局認證為“中西成藥、中藥材”商品（服務）使用上的雲南省著名商標。
2007年11月1日，重慶健之佳第壹家店開業，跨省發展又邁向新的臺階。
2007年12月，健之佳被昆明聖火藥業集團有限公司補定為全國範圍內的年度“最佳零售合作”夥伴之壹。
2007年12月，健之佳在北京同仁堂科技發展股份有限公司2007年度營銷工作中精誠合作成績優秀，特授予北京同仁堂科技發展股份有限公司“最佳合作獎”。
2007年12月，健之佳被***青團雲南省委青年與社會雜誌社授予“愛心助學先進單位”。
2007年12月，健之佳零售連鎖門店達到450家，全年實現銷售5億元。
2008年1月，健之佳被盤龍區人民政府被為“2007年度納稅光榮戶。
雲南健之佳健康連鎖店股份有限公司持有的“健之佳”商標被國家工商行政管理總局認定為“中國馳名商標”。成為雲南省首家在服務類商標上獲得“中國馳名商標”的企業，也是雲南省唯壹壹家獲此殊榮的連鎖藥店。