風濕免疫科、神經外科、普外科、骨外科、腫瘤科、消化內科、腫瘤外科、傳染科、心血管內科、神經內科、呼吸內科、婦產科、兒科為省級重點學科和省級重點學科、溫州醫學院重點學科、市級重點學科，承擔著全市危重病人的救治搶救和診療任務。承擔著全市疑難雜癥的診治和危重病人的搶救任務。醫院設有腦科中心、微創中心、介入治療中心、基因診斷中心、器官移植中心、生殖輔助中心、糖尿病防治中心、骨關節炎防治中心、整形美容中心、睡眠障礙診療中心、驗光配鏡中心。
醫院還負責麗水市醫學會臨床藥學分會、神經外科分會、心血管分會、感染性疾病分會、血液病分會、神經內科分會、兒科分會、風濕病分會、肝病分會、疼痛分會、微創外科分會、介入放射分會等12個學會，市臨床檢驗質量控制中心、消化內科中心、急診質控中心、藥事管理質控中心、產科質控中心、腫瘤診療質控中心、口腔科質控中心、7 個醫技中心，以及市中西醫結合學會、市畬醫學會、市糖尿病防治協會、市骨關節病防治協會等學術交流和技術指導。是中國中西醫結合學會燒傷治療基地。
醫院與浙江大學醫學院附屬第壹醫院、附屬兒童醫院、附屬口腔醫院、省人民醫院、上海九院為合作協作醫院。與浙江大學醫學院附屬第壹醫院、附屬第二醫院長期建立健康網絡視頻語音平臺，專家通過網絡實現面對面會診，讓麗水市民享受到危重病、疑難病隨時看 "省級專家 "的便利。
門診每年應用的新技術有幾十項。輔助生殖技術、冠狀動脈支架植入術、各種永久起搏器植入術、心律失常射頻消融根治術、80余種普外科、婦產科、泌尿外科、胸外科等腹腔鏡微創手術、70余種心臟、顱腦、肝臟、血管等介入手術，先天性、風濕性心臟病手術，心腦血管疾病、骨關節炎、風濕病、糖尿病等防治技術在全市處於全面領先水平。技術處於全市領先水平，部分技術處於國內先進水平。已開展肝、腎等大器官移植近200例。
醫院先後2次獲得全國文明先進集體榮譽稱號，連續21年獲得省級文明單位榮譽稱號，先後榮獲全國三八紅旗先進集體、省優秀基層黨校、省醫療質量管理先進單位、省衛生系統思想政治工作先進單位、省優秀教學醫院等國家、省、市級榮譽稱號50余項。