隨著軍隊建設的需要，1995年根據中央軍委整頓軍辦企業的有關指示，“部隊企業不能用部隊的番號和代號，並壹律移交到當地最高軍事機關統壹管理”的指示精神，成都軍區後勤部貴陽環保設備更名為貴州長城環保設備總廠，並移交到貴州省軍區直接管理。1998年遵照國務院和中央軍委關於軍隊、武警部隊、政法、機關不再從事經營性活動的重大決策，貴州長城環保設備總廠被移交給地方。為適應國家經濟體制改革的進程，貴州長城環保設備總廠於2000年7月變更為貴州長城環保科技有限公司。
該公司創建以來已有30多年的歷史，先後為全國4800多家企業汙染工程進行了汙水治理，工程案例有涉及醫院、食品、生活、榨菜、化工、亞麻、印染、酒精、制糖、牛奶養殖等廢水和汙水處理工程，在我國北京、山東、河北、貴州、山西、四川、內蒙古、黑龍江、廣東、廣西、陜西、甘肅、寧夏、新疆、江蘇、吉林、河南、湖北、天津等全國各地（除港、奧、臺外），其中醫院汙水治理工程就有3000多家，醫院汙水處理規模從大到3500床，到小到20床以下的衛生院不等，這些工程處理結果全部達到國家規定的排放標準。
近年來隨著國家對節能減排工作的重視和深入，該公司在四川攀枝花第三人民醫院建成國內首座中水回用工程，2010年在河北省承德醫學院附屬醫院汙水處理中水回用工程，得到了承德市政府，市人大、市政協的高度評價。
貴州長城環保科技有限公司具有發治理工藝設計、環境工程設計、環保設備研制的專業化企業，是集科工貿，產供銷於壹體的高新企業。公司占地面積22畝多，其中辦公區8畝多，生產區14畝多。具有近億元的企業資產，年產值7000多萬元，利潤近千萬，是我國具有較高知名度的優秀環保企業，也是我國最專業的醫院汙水處理公司。最近設計的貴州省武警總隊醫院采用協同催化氧化法處理該水，不用消毒藥劑，汙水處理後又達到中水回用標準，以及近期完工的解放軍25醫院、新疆石河子醫學院，昌吉市人民醫院等壹大批具有目前代表性的醫院汙水處理工程。