1、熱滅菌法
熱滅菌法利用高溫使微生物細胞內的壹切蛋白質變性，酶活性消失，致使細胞死亡。通常有幹熱、濕熱和間歇加熱滅菌等法。
2、幹熱滅菌
火焰灼燒法或烘箱內熱空氣滅菌法稱為幹熱滅菌法（dryheatsterilization）。
把金屬器械或洗凈的玻璃器皿放入電熱烘箱內，在150～170℃下維持1～2小時後，可達到徹底滅菌（包括細菌的芽孢）的目的。灼燒（incineration或combustion）是壹種最徹底的幹熱滅菌法，應用範圍僅限於接種環、接種針的滅菌或帶病原菌的材料、動物屍體的燒毀等。
3、化學試劑滅菌
大多數化學藥劑在低濃度下起抑菌作用,高濃度下起殺菌作用。常用5%石炭酸、70%乙醇和乙二醇等。化學滅菌劑必須有揮發性，以便清除滅菌後材料上殘余的藥物。
化學滅菌常用的試劑有表面消毒劑、抗代謝藥物（磺胺類等）、抗生素、生物藥物素抗生素是壹類有微生物或其他生物生命活動過程中的合成的次生代謝產物或人工衍生物，他們在很低濃度時就能抑制或感染它種生物（包括病原菌，病毒，癌細胞等）的生命活動，因而可用作優良的化學治療劑。
4、間歇滅菌
間歇滅菌連續3天,每天進行壹次蒸氣滅菌的方法。此法適用於不能耐 100℃以上溫度的物質和壹些糖類或蛋白質類物質。壹般是在正常大氣壓下用蒸氣滅菌1小時。滅菌溫度不超過100℃,不致造成糖類等物質的破壞，而可將間歇培養期間萌發的孢子殺死，從而達到徹底滅菌的目的。
5、輻射滅菌
輻射滅菌在壹定條件下利用射線進行滅菌的方法。較常用的有紫外線，其他還有電離輻射（射線加快中子等）。波長在25000～80000納米之間的激光也有強烈的殺菌能力,以波長26500納米最有效。輻射滅菌法僅限於某壹定材料，因所需設備復雜，難於廣泛使用。
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