太空中使用的藥物大致有兩種。壹類是常見病用藥，如治療外傷的紫色藥水、消毒壓迫繃帶、抗菌軟膏、鎮靜止痛註射液、止瀉胃腸炎片、抗感冒降壓藥、消炎抗生素等。另壹種是特殊藥物治療。其中包括:
1.抗太空運動病藥物
太空暈動病是太空活動中的常見病，類似於地球上的“暈船”和“暈車”。這種疾病在發病時，癥狀包括臉色蒼白、出汗、惡心、嘔吐、上腹部不適和食欲不振，持續時間從幾個小時到幾天不等，影響宇航員的健康，降低工作效率。
美國和前蘇聯有三分之壹到四分之壹的宇航員曾經患過這種病。可見，太空暈動病發病率高，波及面廣。服用太空暈動病藥物，對抑制和緩解暈動病癥狀有壹定作用。這些藥物包括抗膽堿能藥和抗組胺藥。在早期的太空飛行中，美國宇航員服用了抗組胺藥物，如惡嗪和甘特，後來又研究了東莨菪堿和去氧腎上腺素。單獨服用不如復方有效。除了內服，還有壹種帶藥膏的膠布，可以貼在頭部皮膚上，通過皮膚吸收達到治療效果。
2.抗輻射藥物
在太空飛行的宇航員面臨兩方面的太空輻射風險。
壹個是空間粒子輻射，包括太陽耀斑和地球輻射帶的粒子。如果發生太陽耀斑，宇航員可能受到的輻射劑量為上半身皮膚350 ~ 800雷姆。
第二種是人工輻射源，比如核動力和航天器上攜帶的核電池。
據測量，雖然美蘇宇航員受到的輻射大多沒有超過允許標準，但少數飛船上的宇航員，如雙子座、阿波羅14和聯盟35號，在太空中受到了相當大的輻射量，其中兩名在太空飛行175天的前蘇聯宇航員受到了7雷姆。因此，藥物預防是保護航天員健康的措施之壹。這類常用藥物有磺胺嘧啶、氨基2-異硫脲，對高能原子有壹定的保護作用，可與維生素合用。
3.抗脫鈣藥物
在失重的影響下，尿中鈣、磷、鎂等無機鹽的排出量增加，月流失量壹般為人體總量的0.3% ~ 0.5%，相當於臥床測試者脫鈣量的3倍，人體骨骼承重重量的流失量大於這個比例。大量脫鈣的後果，除了腎結石的風險外，還可能是因為回到地球後嚴重骨質疏松，以至於輕微的用力和活動都會引起骨折，尤其是脊柱或長骨的骨折。為了防止脫鈣，除了適當的物理治療和飲食治療外，藥物治療也是重要的預防措施。這些藥物包括磷酸鈣制劑。服用此類藥物的宇航員骨鈣流失明顯低於不服用藥物的宇航員。
4.調節睡眠的藥物
長期太空飛行中，航天員會出現情緒激動、幻想、幻覺、多夢等異常情緒，嚴重幹擾睡眠，影響工作效率和身體健康。因此，飛船配備了壹些鎮靜劑和催眠藥，供宇航員服用，以調節他們的睡眠。這些藥物服用後應該很快見效，醒後藥效很快消失，應該不會出現嗜睡、無精打采等副作用。前蘇聯的空間站禮炮配備了鎮定劑等安眠藥，美國的阿波羅飛船配備了速眠、鎮靜劑等安眠藥和針劑。美國航天飛機上的宇航員曾受到靜電幹擾，地面控制中心打電報讓他們服用指定的安眠藥和鎮定劑，然後他們很快就睡著了。
5.提高工作能力的藥物
人在飛船環境中工作，要經受失重、超重、噪音、高溫、低溫、特殊照明、狹窄環境等特殊環境的考驗。人的感覺功能、運動功能、大腦中樞功能都會因這種環境而疲勞，對工作產生影響。特別是在長時間的太空飛行中，這種疲勞會出現周期性循環，服用壹些提高工作能力的藥物可以消除疲勞。這類藥物既有苯丙胺等強效興奮劑，也有人參、刺五加、臉紅天等非特異性藥物。前者有省錢的作用，容易上癮，降低食欲；後者刺激性小，持續時間長。它們各有利弊，但對提高工作效率、穩定工作情緒都有壹定的促進作用。因此，宇航員在太空飛行中即使沒有疾病，也應該服用壹些藥物來促進工作，增強活動能量，否則壹旦疲勞發作，就會分散工作註意力，帶來不良後果。
飛船裏的藥箱不完全是為疾病設置的，還有休息和工作用的。藥有幾十種。這裏列出了美國阿波羅飛船駕駛艙內藥箱中的藥品，顯示了宇航員服藥的情況。