B.診斷方法不同:西醫對疾病的診斷也是建立在科學理論基礎上的，同時也需要大量的戒律。中醫由四診(望、聞、問、脈)和人參組成。藏醫主要通過問診、脈診、尿診來診斷疾病。還有藥物試驗。綜合分析總結三診診斷所得印象，從病因判斷疾病性質，從癥狀體征判斷疾病類型。
C.治療原則不同:西醫在治療疾病時，更註重生命體征的監測和治療，使疾病“細微化”，對癥治療，或通過手術治療。抗生素在醫學上應用廣泛，但濫用後會對身體產生依賴性和耐藥性。中醫在確定病情後進行綜合調整，但見效較慢，常用於治療慢性病。藏醫病情確定後，“龍”病可以治愈“龍”，也可以同時調節三大因素。
D.藥物成分差異很大:西藥多為生物制劑或合成制劑，科學性很高，但往往會引起很多副作用。藏藥相對於中藥的優勢在於藥材的質量，藏藥中含有大量的礦物質。
E.服用方式不同:西藥多為片劑或註射劑，在使用上有很大的局限性，在費用和時間上有很大的缺點。中藥多為片劑或湯劑。湯劑服用時也有很大的局限性。藏藥因成分奇特，價格昂貴，加工難度大，且常制成丸劑長期保存，加工過程中不得含有任何化學汙染。因此，為了充分吸收藥物，需要口服或在水中服用。與西藥註射劑、中藥湯劑或藥物毒性相比，具有很大的優勢。