集裝箱種類很多，分類方法多種多樣，有以下分類方法
按所裝貨物種類分
有幹貨集裝箱（DRY CONTAINER）、散貨集裝箱（BULK CONTAINER）、液體貨集裝箱、冷藏箱集裝箱，以及壹些特種專用集裝箱，如汽車集裝箱、牧畜集裝箱、獸皮集裝箱等。
雜貨集裝箱是是最普通的集裝箱，主要用於運輸壹般雜貨，適合各種不需要調節溫度的貨物使用的集裝箱，壹般稱通用集裝箱。
散貨集裝箱是用以裝載粉末、顆粒狀貨物等各種散裝的貨物的集裝箱。
液體貨集裝箱是用以裝載液體貨物的集裝箱。
冷藏集裝箱是壹種附有冷凍機設備，並在內壁敷設熱傳導率較低的材料，用以裝載冷凍、保溫、保鮮貨物的集裝箱。
汽車集裝箱是壹種專門設計用來裝運汽車，並可分為兩層裝貨的集裝箱。
牲畜集裝箱（PEN CONTAINER）是壹種專門設計用來裝運活牲畜的集裝箱，有通風設施，帶有餵料和除糞裝置。
獸皮集裝箱是壹種專門設計用來裝運生皮等帶汁滲漏性質的貨物，有雙層底，可存貯滲漏出來的液體的集裝箱。
制造材料是指集裝箱主體部件（側壁、端壁、箱頂等）材料，可分成三種：有鋼制裝箱、鋁合金集裝箱、玻璃鋼集裝箱，此外還有木集裝箱、不銹鋼集裝箱等。
其中：鋼制集裝箱，用鋼材造成，優點是強度大，結構牢，焊接性高，水密性好，價格低廉；缺點是重量大、防腐性差； 鋁合金集裝箱，用鋁合金材料造成，優點是重量輕，外表美觀，防腐蝕，彈性好，加工方便以及加工費、修理費低，使用年限長；缺點是造價高，焊接性能差；
玻璃鋼集裝箱，用玻璃鋼材料造成，優點是強度大，剛性好，內容積大，隔熱、防腐、耐化學性好，易清掃，修理簡便；缺點是重量大，易老化，擰螺栓處強度降低。
有冷凍集裝箱（REEFER CONTAINER），簡寫RF，掛衣集裝箱（DRESS HANGER CONTAINER），開頂集裝箱（OPEN TOP CONTAINER）簡寫OT，框架集裝箱（FLAT RACK CONTAINER）簡寫FR，罐式集裝箱（TANK CONTAINER）簡寫TK、冷藏集裝箱、平臺集裝箱（PLATFORM CONTAINER）、通風集裝箱（VENTILATED CONTAINER）、保溫集裝箱（INSULATED CONTAINER）。
開頂集裝箱是用於裝載玻璃板，鋼制品，機械等重貨，可以使用起重機從頂部裝卸，開頂箱頂部可開啟或無固定項面的集裝箱。
框架集裝箱是以箱底面和四周金屬框架構成的集裝箱，適用於長大、超重、輕泡貨物。
罐裝集裝箱是由箱底面和罐體及四周框架構成的集裝箱，適用於液體貨物。
平臺集裝箱是專供裝運超限貨物的集裝箱，有壹個強度很大的底盤，在裝運大件貨物時，可同時使用幾個平臺集裝箱。