鼓勵創新、加強專利權保護是這次專利法修改的主旋律，貫穿於專利法的全過程。2000年專利法第二次修改時規定:“為了保護發明創造專利權，鼓勵發明創造，有利於發明創造的推廣應用，促進科學技術進步和創新，適應社會主義現代化建設的需要，制定本法。”與之前的專利法相比，該條主要突出了“科技創新”的重要意義和作用，使得“創新”首次在我國專利法中獲得了前所未有的地位。專利法的這次修改，進壹步增強了專利立法推動創新的重大意義和使命。規定:“為了保護專利權人的合法權益，鼓勵發明創造，促進發明創造的應用，提高創新能力，促進科學技術進步和經濟社會發展，制定本法”。與2000年專利法相比，主要強調“提高創新能力”，同時將“有利於發明創造的推廣應用”改為“應用促進發明創造”，強化了專利法促進發明創造的功能和作用，與“提高創新能力”相符合。這次修改有著深刻的現實原因和前瞻性意義，證明了我國已經把提高自主創新能力、建設創新型國家作為國策和戰略舉措。
(二)註重提高專利質量
專利法實施初期，基於當時經濟、科技和社會發展水平相對落後，發明和自主創新能力不足，為了鼓勵發明創造，保證專利申請和授權的原始積累和後期增長，對專利授權條件采取了較低的標準。例如，在發明、實用新型和外觀設計專利的新穎性標準中，不采用大多數國家的絕對新穎性標準，而是采用更為寬松的相對新穎性標準，即對現有技術和現有設計規定不同的地域範圍。這種相對新穎性的標準既減輕了專利審查員審查專利申請的負擔，又適當增加了專利數量，在壹定程度上提高了專利申請的積極性，增加了專利權的穩定性。
隨著專利制度的不斷完善和創新能力的不斷增強，我國專利申請量逐年增加。截至2009年3月，* * *受理的專利申請總量超過500萬件。專利授權量也保持了較高的增長速度。截至5438年6月底+2008年2月，* * *累計授權專利超過250萬件，近5年授權專利數量占專利法實施23年來授權總數的近60%。在我國專利申請和授權絕對數量位居世界前列的同時，在有效專利數量、關鍵技術專利掌握情況等專利質量衡量指標上，我國與世界專利強國仍有較大差距。專利法面臨的問題已經轉變為如何提高專利質量，如何充分發揮專利制度促進自主創新。因此，有必要通過嚴格的專利授權標準等措施來促進專利質量的優化。
在專利法第三次修改中，專利新穎性的標準由相對新穎性改為絕對新穎性。同時，對外觀設計專利制度進行了改革，增加了類似發明和實用新型專利的“創造性”標準，以避免通過模仿現有設計或簡單拼湊現有設計特征而形成的外觀設計獲得專利。規定“在平面印刷品的圖案、顏色或者兩者的結合上主要起標誌作用的設計”不授予專利權；介紹了相關設計的專利申請制度。通過充分保護外觀設計專利申請人的合法權益，可以鼓勵他們從事設計創新，進而促進我國設計的整體水平。
(3)加強專利權保護
專利權作為壹種保護發明創造成果的私權，以其獨占性和排他性，使相關發明創造在壹定期限內由權利人依法獨占，通過自行實施專利或者許可他人實施專利，使創新獲得回報。專利法律制度從國家立法層面保護這種專有權，有助於激發人們的創新熱情，促進科技發展。《專利法》第三次修訂擴大了專利保護範圍，加大了行政處罰力度，完善了對專利權人的保護措施。
1，擴大專利保護範圍
新專利法第11條第2款規定:“外觀設計專利被授予後，未經專利權人許可，任何單位或者個人不得實施其專利，即不得為生產經營目的制造、許諾銷售、銷售或者進口其專利產品”。增加了外觀設計專利權人的“許諾銷售權”，使三種專利保護達到平衡，更好地維護外觀設計專利權人的權益。
2.行政處罰力度有所提高。
中國的專利保護采取兩種方式:行政保護和司法保護。實踐證明，專利行政執法符合我國國情，對及時制止專利侵權行為、維護專利權人合法權益、維護社會經濟關系穩定發揮了重要作用。由於專利行政執法在我國專利保護中壹直發揮著重要作用，新專利法不僅保留了這壹模式，還提高了行政處罰標準，並參照商標法、著作權法等知識產權法的規定，強化了專利行政執法權限。具體來說，體現在以下兩個方面:
壹是整合了對假冒他人專利和假冒專利的處罰，提高了行政處罰的標準。2008年專利法將2000年專利法第五十八條、第五十九條合並為第六十三條，修改為:“除依法承擔民事責任外，由專利管理部門責令改正並予以公告，沒收違法所得，可以並處違法所得四倍以下的罰款；沒有違法所得的，可以處20萬元以下的罰款；構成犯罪的，依法追究刑事責任。”
二是賦予了專利工作行政主管部門查處假冒行為必要的行政執法手段。2008年《專利法》增加壹條，作為第六十四條:“管理專利工作的部門根據取得的證據對涉嫌假冒專利行為進行調查處理時，可以要求有關方面調查與涉嫌違法行為有關的情況；對當事人涉嫌違法行為的場所進行現場檢查；查閱、復制與涉嫌違法行為有關的合同、發票、賬簿及其他相關資料；檢查與涉嫌違法行為有關的產品，查封或者扣押被證明是假冒專利的產品。管理專利工作的部門依法行使前款規定的職權時，當事人應當協助和配合，不得拒絕和阻撓。”該條類似於我國現行《商標法》第五十五條的規定，旨在通過賦予專利管理部門查處假冒行為的行政職權，加強專利行政執法，進壹步加強對專利權的保護。
3.完善保護專利權人的措施。
此次修改明確將權利人的維權成本納入侵權賠償範圍，提高了對專利權人財產的保護。同時增加了關於訴前臨時措施和證據保全的規定，進壹步增加了積極保護專利權人權益的法律保障。
壹是明確專利侵權賠償應當包括權利人維權的費用，增加了法定賠償的規定。2000年《專利法》第六十條規定:“侵犯專利權的賠償數額，按照權利人因侵權所受到的損失或者侵權人因侵權所獲得的利益確定；侵權人的損失或者侵權人獲得的利益難以確定的，參照專利許可費的倍數合理確定。”該規定存在兩個問題:壹是沒有明確權利人因侵權所受損失和侵權人因侵權所獲利益應當選擇哪壹種作為優先計算方法；第二，在其中規定的三種方法難以計算的情況下，專利侵權損害賠償額如何確定，沒有考慮。為解決上述問題，新專利法規定，專利侵權的賠償數額應當按照權利人因侵權所遭受的實際損失確定；實際損失難以確定的，可以按照侵權人因侵權所獲得的利益確定。權利人的損失或者侵權人的利益難以確定的，應當參照專利許可費的倍數合理確定。賠償數額還應當包括權利人為制止侵權行為所支付的合理費用。權利人的損失、侵權人獲得的利益、專利許可費難以確定的，人民法院可以根據專利權的類型、侵權行為的性質和情節等因素，確定654.38+0萬元以上654.38+0萬元以下的賠償。這樣，壹方面增加了專利侵權糾紛中確定損害賠償數額的可操作性；另壹方面，明確建立了專利侵權損害法定賠償制度，這與《著作權法》和《商標法》的規定是壹致的。
二是增加了訴前臨時措施和訴前證據保全的規定。實踐中，有時會出現侵犯專利權人專利權的行為，如果不及時制止，會對專利權人的合法權益造成不可挽回的損害。但按照通常的訴訟程序，需要先起訴，人民法院的判決發生法律效力，才能徹底制止侵權人侵犯專利權的行為。此時，侵權行為已經發生，甚至造成了嚴重後果。因此，為了充分保護專利權人的合法權益，許多國家的專利立法都規定了訴前“臨時措施”，即在訴訟前向法院申請責令停止相關行為。2000年第二次修改專利法時，將這壹制度加入其中。2008年專利法專門規定了訴前責令停止相關行為的程序，便於實踐中操作。此外，為防止侵權人在專利權人提起訴訟前轉移或者銷毀證據，增加了為制止專利侵權行為，在證據可能滅失或者以後難以取得的情況下，權利人可以在提起訴訟前向人民法院申請證據保全。
(四)進壹步推動技術應用
壹方面，新《專利法》規定專利權* * *的所有人可以單獨實施，也可以以普通許可的方式許可他人實施。既保證了* * *人對* * *擁有專利的合法權利，又促進了* * *專利的實施。增加了防止專利權濫用的規定，對不實施或者不完全實施其專利的行為以及因行使專利權而導致的壟斷行為，進壹步明確了強制許可措施。促進專利技術的流通、推廣和應用。另壹方面，為了防止惡意利用已知的現有技術申請專利，阻礙現有技術的實施，幫助現有技術的實施者及時擺脫專利侵權糾紛，引入了現有技術抗辯原則，規定實施的技術屬於現有技術的，不構成專利侵權。
(5)履行國際條約
遵守有關知識產權的國際公約和規則壹直是中國知識產權立法的重要原則之壹。我國專利法在授權標準、保護級別、強制許可等壹系列制度設計中體現了這些國際規則的精神。為適應相關國際公約對專利的要求，履行對外承諾，根據國際知識產權公約的最新發展和我國加入國際公約的情況，適時修改專利法的相關內容是必要和必要的。《專利法》第三次修改體現了在遺傳資源保護、公共衛生目的專利藥品強制許可等方面與國際條約的銜接，規定依賴遺傳資源的發明創造應當標明遺傳資源的來源，在此基礎上非法獲得或者利用的發明創造不授予專利權；增加了藥品和醫療器械實驗例外(Bolar exception)的規定，使公眾在藥品和醫療器械專利保護期屆滿後，能夠及時獲得更便宜的仿制藥和醫療器械，對解決公眾健康問題具有重要意義。