黑衣組織是壹個籠罩在神秘色彩中的跨國犯罪組織。江戶川柯南稱其為“烏鴉軍團”。工藤新壹就是因為被該組織成員琴酒灌下藥物APTX4869而導致身體縮小，開始了整個故事。黑衣組織成立的目的，最初還是在藥品的研究，在隨後幾十年的變遷了，逐漸演變成黑暗勢力，成為跨國的犯罪集團，大概是目的實現了，犯罪就成為了主要業務。
APTX4869的主要作用是誘導程序性細胞死亡，同時強化端粒酶的活性，從而增加細胞的增值能力。因為這個藥物暫時還在研發階段，無法保證藥性，所以壹般情況下會導致服用者死亡。但新壹和雪莉卻是特例，因為細胞自我破壞程序的偶然作用。之前，組織也研究過壹種藥物，吃了之後確實可以使人壹直保持在年輕，精力充沛的狀態，這個人就是貝爾摩得。但是這個藥物也失敗了。因為雖然這個藥可以使人壹直保持在最年輕力勝的狀態，但是需要定時的服用這種藥，要不然人體就會因為消耗過度而死亡。
組織研究藥物也不是什麽特殊用途，就是為了方便自己的成員暗殺使用，另外就是為了賣錢，然後意外的發明了柯南、灰原哀吃下去的這種“特殊藥物”這都是在巧合下發明出來地。讓我們先註意壹下灰原說過的壹句話“工藤，妳還不知道吧，組織跟半世紀前的計劃就有關系”。這句話意味著該組織的歷史非常長。從時間上推算，灰原說這句話大概在1995-1996年左右（按照柯南世界的時間）。
根據漫畫第1008話的信息，可以視為原作者青山剛昌親自確定了，黑衣組織的幕後首腦是烏丸蓮耶。漫畫1011話，安室透對灰原哀母親宮野艾琳娜的回憶中，也揭示了當初宮野夫婦是接受了烏丸集團的邀請加入研究。所以，黑衣組織的BOSS也就是烏丸蓮耶。