藥物化學（Medicinal chemistry）是利用化學的概念和方法發現確證和開發藥物，從分子水平上研究藥物在體內的作用方式和作用機理的壹門學科。作為專業，是2011年新增的本科專業，研究任務包括：研究藥物的化學結構和活性間的關系（構效關系）；藥物化學結構與物理化學性質的關系；闡明藥物與受體的相互作用；鑒定藥物在體內吸收、轉運、分布的情況及代謝產物；通過藥物分子設計或對先導化合物的化學修飾獲得新化學實體創制新藥。
2、藥物化學專業主要課程
有機化學，生物化學，生理學，藥理學，高等藥物化學，藥物合成設計，藥物合成反應，近代有機合成，甾體、抗腫瘤、抗病毒前沿研究跟蹤，藥物設計進展，天然產物化學，有機光譜鑒定，有機結構測定的物理方法，現代生物技術與新藥研究開發等。
3、藥物化學專業培養目標
培養目標
本專業主要培養具有藥學、管理學、經濟學、法學等相關的知識和技能，能在藥品部門及相關機構從事藥物化學分析、藥事與企業管理、策劃以及教學、科研等方面的工作，探索藥物化學事業科學發展規律的復合型高級人才
培養要求
通過本專業的學習，使學生能夠熟悉化學藥物的結構、理化性質、體內代謝及臨床應用，為有效、合理地使用化學藥物提供理論依據，為從事新藥研究奠定理論基礎。
4、藥物化學專業就業方向與就業前景
該專業的畢業生，因為有著紮實的生化研究和分析的基礎，則也有著多方面的就業機會，壹是可以進入日用化工行業，二是可以進入生化藥品行業，三是可以進入石油化工行業，四是可以直接進入制藥和從事藥物制劑開發、研究、質檢以及銷售代理崗位。
二、藥物化學專業大學排名
1. 中國藥科大學 A+
2. 北京大學 A+
3. 沈陽藥科大學 A+
4. 中國海洋大學 A
5. 四川大學 A
6. 重慶大學 A
7. 武漢大學 A
8. 暨南大學 A
9. 浙江大學 A
10. 山東大學 A
11. 復旦大學 A
12. 廣東藥學院 A
13. 浙江工業大學 A