消毒時，在池塘周圍挖若幹大小合適的池塘註水，然後將生石灰放入池塘融化，趁熱立即溢出整個池塘。第二天再用短柄泥耙推耙池塘，讓石灰粉和河泥充分混合，提高實際消毒效果。二是用水消毒。生石灰用量為60 ~ 75公斤/畝。生石灰溶解後，在受熱對稱的同時，撒滿池水。巴豆消毒在蝦蟹養殖的江面實際效果更好。用量為2-8克/立方米。將巴豆搗碎放入水桶中，用3%的鹽水浸泡，封住桶口。
2 ~ 3天後，渣汁均勻灑滿全池。池塘消毒是水產品養殖的壹個非常關鍵的全過程，它不僅關系到水產品能否有壹個良好的生存環境，而且對水產品病蟲害的預防和調控有著重大的現實意義。用於池塘消毒的常用消毒劑的關鍵是生石灰、漂白液和二氧化氯。其中，生石灰的應用是目前最常見的，用量也較大。
用生石灰消毒:用生石灰消毒有幹消毒和幹消毒兩種方式。對於新挖的池塘，最好進行幹消毒。二氧化氯消毒時，先將檸檬酸鈉和二氧化氯分別按1:1的比例混合，然後在10分鐘內用自來水稀釋，二氧化氯用量為1畝，每米水位為1200-1800g。在給池塘消毒的整個過程中，自來水都是用消毒劑稀釋的。但需要註意的是，不允許用油桶裝消毒劑。