消毒藥品種類繁多，按其性質可分為：醇類、碘類、酸類、堿類、鹵素類、酚類、氧化劑類、揮發性烷化劑類等。畜禽飼養場常用以下幾種消毒藥：
（1）氫氧化鈉（又稱苛性鈉、燒堿或火堿）
堿類消毒劑，粗制品為白色不透明固體，有塊、片、粒、棒等形狀；成溶液狀態的俗稱堿液，主要用於場地、欄舍等消毒。
2%～4%溶液可殺死病毒和繁殖型細菌，30%溶液10分鐘可殺死芽孢，4%溶液45分鐘殺死芽孢，如加入10%食鹽能增強殺芽孢能力。實踐中常以2%的溶液用於消毒，消毒1～2小時後，用清水沖洗幹凈。
（2）石灰（生石灰）
堿類消毒劑，主要成分是氧化鈣，加水即成氫氧化鈣，俗名熟石灰或消石灰，具有強堿性，但水溶性小，解離出來的氫氧根離子不多，消毒作用不強。
1%石灰水殺死壹般的繁殖型細菌要數小時，3%石灰水殺死沙門氏菌要1小時，對芽孢和結核桿菌無效。其最大的特點是價廉易得。實踐中，20份石灰加水到100份制成石灰乳，用於塗刷墻體、欄舍、地面等，或直接加石灰於被消毒的液體中，或撒在陰濕地面、糞池周圍及汙水溝等處消毒。
（3）賽可新（Selko-pH）
酸類消毒劑，主要成分是復合有機酸，用於飲水消毒，用量為每升飲水添加1.0～3.0毫升。
（4）農福
酸類消毒劑，由有機酸、表面活性劑和高分子量殺微生物劑混合而成。對病毒、細菌、真菌、支原體等都有殺滅作用。常規噴霧消毒作1∶200稀釋，每平方米使用稀釋液300毫升；多孔表面或有疫情時，作1∶100稀釋，每平方米使用稀釋液300毫升；消毒池作1∶100稀釋，至少每周更換壹次。
（5）醋酸
酸類消毒劑，用於空氣熏蒸消毒，按每立方米空間3～10毫升，加1～2倍水稀釋，加熱蒸發。可帶畜、禽消毒，用時須密閉門和窗。市售酸醋可直接加熱熏蒸。
（6）漂白粉
鹵素類消毒劑，灰白色粉末狀，有氯臭，難溶於水，易吸潮分解，宜密閉、幹燥處儲存。殺菌作用快而強，價廉而有效，廣泛應用於欄舍、地面、糞池、排泄物、車輛、飲水等消毒。飲水消毒可在每噸河水或井水中加6～10克漂白粉，10～30分鐘後即可飲用；地面和路面可撒幹粉再灑水；糞便和汙水可按1∶5的用量，壹邊攪拌，壹邊加入漂白粉。
（7）二氧化氯消毒劑
鹵素類消毒劑，是國際上公認的新壹代廣譜強力消毒劑，被世界衛生組織列為A1級高效安全消毒劑，殺菌能力是氯氣的3～5倍，可應用於畜禽活體、飲水、鮮活飼料消毒保鮮、欄舍空氣、地面、設施等環境消毒、除臭。本品使用安全、方便，消毒、殺菌、除臭作用強，單位面積使用價格低。
（8）消毒威（二氯異氰脲酸鈉）
鹵素類消毒劑，使用方便，主要用於養殖場地噴灑消毒和浸泡消毒，也可用於飲水消毒，消毒力較強，可帶畜、禽消毒。使用時按說明書標明的消毒對象和稀釋比例配制。
（9）二氯異氰脲酸鈉煙熏劑
鹵素類消毒劑，本品用於養蠶消毒及畜禽欄舍、飼養用具的消毒；使用時，按每立方米空間2～3克計算，置於畜禽欄舍、蠶室中，關閉門窗，點燃後即離開，密閉24小時後，通風換氣即可；還可用於蘑菇房、蔬菜大棚消毒。
（10）氯毒殺
鹵素類消毒劑，使用同消毒威。
（11）百毒殺
雙鏈季銨鹽廣譜殺菌消毒劑，無色、無味、無刺激和無腐蝕性，可帶畜、禽消毒。配制成0.03%或相應的濃度用於畜禽圈舍、環境、用具、種蛋、孵化室的消毒，0.01%的濃度用於飲水消毒。
（12）東立銨碘
雙鏈季銨鹽、碘復合型消毒劑，對病毒、細菌、黴菌等病原體都有殺滅作用。可供飲水、環境、器械、畜禽和種蛋等消毒；飲水、噴霧、浸泡作1∶2000～2500稀釋，發病時作1∶1000～1250稀釋。
（13）菌毒滅
復合雙鏈季銨鹽滅菌消毒劑，具有廣譜、高效、無毒等特點，對病毒、細菌、黴菌及支原體等病原體都有殺滅作用。飲水作1∶1500～2000稀釋；日常對環境、欄舍、器械消毒（噴霧、沖洗、浸泡）作1∶500～1000稀釋；發病時作300倍稀釋。
（14）福爾馬林
醛類消毒劑，是37%～40%的甲醛水溶液，有廣譜殺菌作用，對細菌、真菌、病毒和芽孢等均有效，在有機物存在的情況下也是壹種良好的消毒劑，缺點是有刺激性氣味。以2%～5%水溶液用於噴灑墻壁、地面、料槽及用具消毒；房舍熏蒸按每立方米空間用福爾馬林30毫升，置於壹個較大容器內（至少10倍於藥品體積），加高錳酸鉀15克，事前關好所有門窗，密閉熏蒸12～24小時，再打開門窗去味。熏蒸時室溫最好不低於15℃，相對濕度在70%左右。
（15）過氧乙酸
氧化劑類消毒劑，純品為無色澄明液體，易溶於水，是強氧化劑，有廣譜殺菌作用，作用快而強，能殺死細菌、黴菌、芽孢及病毒，不穩定，宜現配現用。0.04%～0.2%溶液用於耐腐蝕小件物品的浸泡消毒，時間1～2小時；0.05%～0.5%或以上噴霧，噴霧時消毒人員應戴防護目鏡、手套和口罩，噴後密閉門窗1～2小時；用3%～5%溶液加熱熏蒸，每立方米空間2～5毫升，熏蒸後密閉門窗1～2小時。