人工和機械控制的方法是人工或機械打撈水葫蘆，見效快，但發生面積大時，勞動強度大。和化學防治壹樣，人工和機械防治也很難將種子從水中清除，防治效果不持久。綜合治理方法是有針對性地采取上述防治措施，取長補短，將水葫蘆種群數量長期控制在較低狀態。
專家認為，目前要想有效制止水葫蘆的野生生長，關鍵是凈化水質，消除適合其生長的環境；同時，水葫蘆還具有壹定的凈水和阻水功能。在適宜的條件下，壹公頃水葫蘆可以吸收800人當天排放的氮磷。水葫蘆還能去除汙水中的鎘、鉛、汞、鉈、銀、鈷、鍶等重金屬元素，從而“變廢為寶”。
根據趨利避害的原則，專家們開發了三條水葫蘆綜合利用的途徑:通過發酵轉化，提高水葫蘆的蛋白質含量，制成飼料；利用水葫蘆含有大量氮、磷、鉀的特性，制成有機無機復混肥。從中提取營養成分，加工提煉食品、保健品、藥品、飼料添加劑。
利用水葫蘆凈化汙水是壹種簡單易行、成本低、節能、效益高的方法。專家表示，未來將推行以水葫蘆治理汙水的模式，讓汙水和水葫蘆都成為寶貴的資源。