關於審計的職能，通過確認和咨詢服務，可以增加組織實現既定目標的機會，確認經營的改善，或降低風險暴露的程度，從而為組織創造價值。
內部審計在企業供應鏈管理中的作用是指內部審計在企業供應鏈管理中的良好作用和功效，主要包括:
(1)確認功能。確認是內部審計的壹項基本而重要的職能。內部審計運用科學、系統、規範的審計方法，實施客觀、公正的審計程序，審查企業供應鏈相關文件和資料的真實性，監督和評價企業供應鏈運作的合規性和效率，對審計過程中發現的所有問題進行問責，充分發揮內部審計在企業供應鏈中發現和糾正錯誤的作用。
具體來說，內部審計的確認功能主要表現在三個方面:
①企業供應鏈戰略的確定。企業供應鏈戰略是企業供應鏈運作的頂層設計，供應鏈戰略的科學性和有效性關系到各項供應鏈管理措施能否促進企業整體經營目標的實現。因此，內部審計應確認和評估企業供應鏈戰略的科學性和有效性，並要求供應鏈戰略負責人對不合理的戰略內容及時進行修改和調整。
②企業供應鏈流程的確認。企業供應鏈流程涵蓋采購、生產、銷售、物流等多個環節。內部審計應當重點確認和評價企業供應鏈流程中各種內部控制制度和活動的有效性、財務活動的適當性、信息溝通機制的順暢性和供應鏈信息系統的安全性，並要求相關部門負責人對相關問題落實整改措施。
③確認企業供應鏈風險和風險管理措施。內部審計壹方面要通過各種科學有效的審計程序，確認和評估企業供應鏈中的核心風險，並要求相關部門針對危害較大的風險制定防範對策；另壹方面，內部審計還應確認和評估供應鏈關鍵風險領域科學有效的風險管理體系，並要求相關部門完善各項規章制度。
(2)咨詢功能。咨詢是關系到內部審計能否發揮增值作用的重要職能。內部審計可以為管理層或其他業務部門提供供應鏈戰略、供應鏈流程控制、供應鏈風險管理和供應鏈信息系統設計方面的咨詢服務。
具體而言，內部審計可以協助企業管理層有效識別企業供應鏈戰略與企業經營目標的偏差，幫助企業完善供應鏈戰略布局；協助采購、生產、銷售、物流等供應鏈相關部門設計和建立內部控制體系、協調溝通機制和信息系統管理方法。
為財務部門提供改進建議，提升企業財務在供應鏈中的支撐作用；完善供應鏈相關部門的風險管理、防範和預警機制，將企業供應鏈的風險降低到可接受的低水平，有效提高企業供應鏈的運行效率，幫助企業實現價值創造。