卓資縣醫療保障局是卓資縣人民政府工作部門，為正科級。 縣醫療保障局貫徹落實黨中央、自治區黨委、烏蘭察布市委關於醫療保障工作的方針政策，落實縣委相關決策部署，在履行職責過程中堅持和加強黨對醫療保障工作的集中統壹領導，主要職責是：貫徹執行國家、自治區、市關於醫療保險、生育保險、醫療救助等醫療保障制度的政策、法規和規章。
協同有關部門編制全縣醫療保障基金預決算草案，組織制定並實施醫療保障基金監督管理辦法，建立健全醫療保障基金安全防控機制，推進醫療保障基金支付方式改革。 組織執行醫療保障籌資和待遇政策。 組織執行城鄉統壹的藥品、醫用耗材、醫療服務項目、醫療服務設施等醫保目錄和支付標準，建立動態調整機制，貫徹執行國家醫保目錄準入談判規則。 貫徹落實國家藥品、醫用耗材價格政策，執行醫療服務項目、醫療服務設施收費等政策，建立醫保支付醫藥服務價格合理確定和動態調整機制，推動建立市場主導的社會醫藥服務價格形成機制，建立價格信息監測和信息發布制度。
組織執行藥品、醫用耗材的招標采購、配送及結算管理政策並監督實施，推進藥品、醫用耗材招標采購平臺建設。 組織實施定點醫藥機構協議和支付管理辦法，建立健全醫療保障信用評價體系和信息披露制度，監督管理納入醫保範圍內的醫療服務行為和醫療費用，依法依規查處醫療保障領域違法違規行為。 負責醫療保障經辦管理和公***服務體系、信息化建設。組織實施異地就醫管理和費用結算政策。建立健全醫療保障關系轉移接續制度。開展醫療保障領域合作交流。
醫保局的單位性質是國家行政機關，隸屬於當地人力資源和社會保障局。醫保局的主要職責：
1.負責受理基本醫療保險、工傷保險、生育保險和離休幹部醫藥費統籌基金的核定、支付、管理以及其它日常事務，
2.為參加基本醫療保險、工傷保險和生育保險的用人單位、職工、離休幹部提供相應的管理服務。
法律依據：《中華人民***和國基本醫療衛生與健康促進法》 第八十二條 基本醫療服務費用主要由基本醫療保險基金和個人支付。國家依法多渠道籌集基本醫療保險基金，逐步完善基本醫療保險可持續籌資和保障水平調整機制。公民有依法參加基本醫療保險的權利和義務。用人單位和職工按照國家規定繳納職工基本醫療保險費。城鄉居民按照規定繳納城鄉居民基本醫療保險費。