設有藥學、藥學(市場營銷方向)和藥物制劑、醫藥營銷(專科)三個本科專業。授予藥學碩士學位，形成了研究生、本科、專科的辦學層次。目前在校本科生769人，專科生75人，研究生58人。我院藥學(本科)專業是省級本科示範專業。目前有省級重點學科1個，院級重點學科1個，省級精品課程1門，院級精品課程2門，主編藥代動力學等本科教材和學術專著5部，主編基礎化學等教材和教學參考書7部，發表專業學術論文337篇。近年來，先後承擔“現代藥物制劑GMP實驗教學中心建設”、“藥學專業實踐教學與質量評價體系探索”等3項中央和地方建設項目、3項省級教改項目、“藥物制劑機械與設備多媒體課件開發”、“藥學野外實踐教學探討”等8項院級教改項目，獲得省級教學成果二等獎1項、三等獎6544項。
藥學院堅持“教學為科研服務，科研促進教學”的發展道路。圍繞我省產業結構調整和特色經濟發展，設立了“貴陽醫學院藥物研發中心-藥物研究所”、“貴州中醫藥民族醫藥研發中心”、“現代藥物制劑GMP實驗教學中心”。現有價值近千萬元的精密儀器和現代化制藥設備，為藥學院的發展提供了難得的教學和科研平臺。同時，我院本著“產學研相結合”、“優勢互補、互利共贏、著眼長遠、共同發展”的原則，與省內外科研機構、兄弟院校、省內醫藥企業建立了長期的教學科研合作關系，通過“走出去”、“請進來”等方式加強交流合作。近年來，承擔了科技部委托、十五計劃、中藥科技產業現代化、企業合作等開發項目72項，獲得科研經費1748萬元，其中13個中藥新藥獲得臨床研究批件或新藥證書，申請或獲得國家發明專利6項。獲國家科技成果進步壹等獎1，國家專利技術發明二等獎1，貴州省科技進步三等獎1，貴陽市科技進步壹等獎1。
近年來，基於貴州醫藥產業發展迅速、藥學人才緊缺的實際，構建了“立足貴州、服務社會”的人才培養體系工程，形成了“理論與實踐互補、教學與社會互動、產學研有機結合”的辦學特色，取得了顯著成效。30年來，培養了2200多名本科生、專科生和碩士生。畢業生有的生活在歐美，有的走上各級領導崗位，有的通過深造獲得博士學位，有的成為企業家、醫藥專家、制藥專家。他們中的許多人已成為貴州醫藥企事業單位的骨幹，為祖國的醫藥事業，特別是為貴州醫藥經濟的發展和醫藥工業的振興做出了積極的貢獻。