抗抑郁藥種類較多，三環類、四環類抗抑郁藥療效好，但副作用較大，對心腦血管、消化系統、內分泌系統影響較大。
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最突出的癥狀是消化道癥狀，表現為惡心、嘔吐、口幹、便秘；心血管癥狀表現為心律失常、各種心電圖改變；而肝腎功能損害，已很少使用。
近年來開發的新型抗抑郁藥，如氟西汀、帕羅西汀、舍曲林、氟伏沙明、草酸艾司西酞普蘭、西酞普蘭、米氮平、文拉法辛等抗抑郁藥，其消化道癥狀的副作用主要表現在服用後出現口幹、便秘、腹瀉等，極少數患者可出現心血管癥狀。
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抗抑郁藥物療效好，耐受性好，副作用不大，但部分人在服藥初期的1-2周內，可出現胃腸道反應，如惡心、口幹或腹瀉、厭食等。如果調整劑量，半個月後，這些癥狀可能會得到緩解。或者患者的頭痛、失眠、焦慮等癥狀也會加重，因此應調整藥物。
抗抑郁藥壹般不會出現依賴性，也不會成癮，因為患者的中樞神經系統神經介質和遞質出現問題，由於缺乏，所以斷藥後可能出現戒斷反應。
這時治療需要徹底，也需要逐漸減藥，不能突然斷藥。還有壹個問題，吃抗抑郁藥會不會發胖，是不是含有激素？其實，它並不含激素，可能是睡眠等方面的改善所致，並非藥物引起的體重增加。
自上世紀60年代以來，抗抑郁藥的種類很多，不同種類的抗抑郁藥有不同的副作用。以目前主流的選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑為例，其常見的副作用分為初期和長期兩種。
初期副作用通常集中在消化道，如患者有惡心、不想吃飯、腹脹、腹瀉等消化道癥狀，有的人會出現頭痛、頭暈、嗜睡，有的人會出現失眠、壹過性焦慮、煩躁，如煩躁不安、燒心、心慌、緊張、心慌等。
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初期的不良反應大多會隨著治療逐漸好轉，癥狀出現好轉後轉為慢性，在慢性期，大多數抗抑郁藥都要經過肝臟代謝，可能會影響肝臟功能，可能會影響新陳代謝，比如引起血糖或血脂異常。還有壹些抗抑郁藥有較好的改善食欲的作用，可能出現體重增加的現象。