小規模納稅人開具或申請代開的增值稅專用發票，統壹使用征收率（3%）為稅率。增值稅的征收率適用於小規模納稅人和特定壹般納稅人。小規模納稅人統壹按3%的征收率計征；對壹些特定的壹般納稅人，則適用6%、5%、4%、3%四檔征收率。具體來說，征收率為6%的項目包括自來水、小型水力發電單位生產的電力、部分建材產品和生物制品；征收率為5%的項目為中外合作開采的原油、天然氣；征收率為4%的項目包括寄售、典當和拍賣商品、銷售舊貨；征收率為3%的項目為公***交通運輸等營改增個別應稅服務。
增值稅小規模納稅人和壹般納稅人的區別
（壹）增值稅壹般納稅人銷售貨物可以自行開具17%增值稅專用發票，購進貨物可以取得17%或3%增值稅專用發票，在繳納增值稅時按照銷項稅額減進項稅額的差額進行納稅，相對稅負較低；
（二）而小規模納稅人在銷售貨物時只能夠委托稅務機關代開3%增值稅專用發票，購進貨物時取得的增值稅專用發票是不可以抵扣的，在繳納增值稅時按照銷售收入3%的簡易稅率計算納稅。
（三）增值稅小規模納稅人同增值稅壹般納稅人相比，有以下兩弱點：
1、繳納增值稅時，增值稅小規模納稅人按照銷售收入乘以3%的簡易稅率計算納稅，而增值稅壹般納稅人按照銷項稅額減進項稅額的方法計算納稅後，應交增值稅占銷售收入的比例壹般要低於3%，有很多企業遠遠低於3%；
2、增值稅小規模納稅人在銷售貨物時只能委托稅務機關代開3%增值稅專用發票，這樣壹來很多增值稅壹般納稅人企業就不會選擇從增值稅小規模納稅人公司購貨，因為增值稅壹般納稅人在購貨時由於不能從增值稅小規模納稅人那裏取得17%的增值稅專用發票用於抵扣銷售稅款，所以就會取消同增值稅小規模納稅人業務往來，從而使得增值稅小規模納稅人失去很多增值稅壹般納稅人客戶；因此，從企業的長遠發展來看，企業要想實現更大的發展，拓展更大的市場，就得成為增值稅壹般納稅人。
法律依據：
《中華人民***和國增值稅暫行條例》下列項目可以免征增值稅：
1、種子、種苗、農用塑料薄膜、有機肥產品和規定的農業機械、化肥、農藥、飼料等農業生產資料，農業（包括種植業、養殖業、林業、牧業和水產業）生產單位和個人銷售的自產初級農業產品；
2、來料加工復出口的貨物；
3、企業為生產中國科學技術部制定的《國家高新技術產品目錄》中所列的產品而進口的規定的自用設備和按照合同隨同設備進口的配套技術、配件和備件；
4、外國政府和國際金融組織貸款項目進口的自用設備（國家另有規定者除外）；
5、企業為引進中國科學技術部制定的《國家高新技術產品目錄》中所列的先進技術而向境外支付的軟件費；
6、避孕藥品和用具；
7、向社會收購的古舊圖書；
8、國家規定的科學研究機構和學校（主要指省、部級單位所屬的專門科研機構和國家承認學歷的實施專科以上高等學歷教育的高等院校），以科學研究和教學為目的，在合理數量範圍以內進口國內不能生產或者性能不能滿足需要的科學研究和教學用品；
9、直接用於農業科研、試驗的進口儀器、設備；
10、外國政府、國際組織無償援助、贈送的進口物資和設備，外國政府、國際組織無償援助項目在中國境內采購的貨物；
11、中國境外的自然人、法人和其他組織按照規定無償向受贈人捐贈進口的直接用於扶貧、慈善事業的物資；
12、中國境外的捐贈人按照規定無償捐贈的直接用於各類職業學校、高中、初中、小學和幼兒園教育的教學儀器、圖書、資料和壹般學習用品；
13、符合國家規定的進口供殘疾人專用的物品；
14、個人銷售自己使用過的物品；
15、承擔糧食收儲任務的國有糧食購銷企業銷售的糧食，其他糧食企業經營的軍隊用糧、救災救濟糧和水庫移民口糧，銷售政府儲備食用植物油；
16、軍事工業企業、軍隊和公安、司法等部門所屬企業和壹般企業生產的規定的軍、警用品；
17、專供殘疾人使用的假肢、輪椅和矯形器；
18、殘疾人個人提供的加工和修理、修配勞務；
19、規定的資源綜合利用產品，包括納稅人自產的再生水、以廢舊輪胎為全部生產原料生產的膠粉、翻新輪胎和生產原料中摻兌廢渣比例不低於30%的特定建材產品（包括燒結普通磚以外的磚、砌塊、陶粒、墻板、管材、混凝土、砂漿、道路井蓋、道路護欄、防火材料、耐火材料、保溫材料、礦棉和巖棉）；
20、規定的汙水處理勞務；
21、血站供給醫療機構的臨床用血；
22、非營利性醫療機構自產自用的制劑；
23、小規模納稅人出口的貨物，國家規定不予退（免）增值稅的貨物除外；
24、邊境居民通過互市貿易進口規定範圍以內的生活用品，每人每日價值人民幣8000元以下的部分，可以免征進口環節的增值稅。
25、自2012年10月1日起，免征部分鮮活肉蛋產品流通環節增值稅。