基毒性雜質（或遺傳毒性雜質Genotoxic Impurity GTI）指化合物本身直接或間接損傷細胞DNA產基突變或體內誘變具致癌能或者傾向潛基毒性雜質（Potential Genotoxic Impurity PGI）結構看類似基毒性雜質警示性未經實驗證明黃曲黴素類、亞硝胺化合物、甲基磺酸酯等化合物均見基毒性雜質許化療藥物具定基毒性良反應由化療藥物細胞基毒性所致順鉑、卡鉑、氟尿嘧啶等
2何著重研究基毒性雜質
基毒性物質特點低濃度即造體遺傳物質損傷進導致基突變並能促使腫瘤發其毒性較強用藥安全性產強烈威脅近越越現已市藥品發現痕量基毒性雜質殘留發範圍醫療事故FDA強行召案例給藥廠造巨經濟損失例某知名際制藥巨歐洲市場推HIV蛋白酶抑制劑維拉賽特錠（Viracept mesylate)2007 7月EMA暫停歐洲所市場其產品發現甲基磺酸乙酯超標甲基磺酸乙酯種經典基毒性雜質該企業付巨代價先內部調查殘留超標原儀器設備清洗乙醇未完全清除殘留與甲基磺酸反應形甲基磺酸乙酯要求解決汙染問題要求做毒性研究更評估患者風險同達25000 名患者暴露於已知遺傳毒性直解決所問題 EMA才恢復歐洲市場授權
近各規機構ICH、FDA、EMA等都基毒性雜質更明確要求越越藥企新藥研發程著重關註基毒性雜質控制檢測
3哪些化合物基毒性雜質
雜質結構種於絕數雜質言往往沒充毒性或致癌研究數據難其進行歸類缺乏安全性數據支持情況些規指導原則采用警示結構作區普通雜質基毒性雜質標誌於含警示結構雜質應進行（Q）SAR預測體內外遺傳毒性致癌性研究或者雜質水平控制毒理關註閾（TTC）
目前般致癌物兩類：類遺傳毒性致癌物通化鍵合直接破壞遺傳物質產致癌性 數化致癌物具遺傳毒性； 第二類非遺傳毒性致癌物 通與發化鍵合作用 產直接破壞 通遺傳物質外間接機制引起致癌作用（ 促進細胞度增殖等）
文獻警示結構匯總於（見原文PDF）關於基雜質警示結具體詳細信息另外參考歐盟發布警示結構《Development of structure alerts for the in vivo micronucleus assay in rodents》或進入 The Carcinogenic Potency Database (CPDB)面 1547 種致癌物質列表結構式CAS 號作用部位TTC 值等系列信息應註意 含警示結構並意味著該雜質定具遺傳毒性 確認遺傳毒性物質定產致癌作用雜質理化性質其結構特點（相質量、親水性、稱性 / 空間位阻、反應性及物代謝速率等）其毒性產抑制或調節作用警示結構重要性於提示能存遺傳毒性致癌性 進步雜質安全性評價控制策略選擇指明向
4基毒性雜質規要求及限度
初ICH相繼推原料藥雜質研究指導原則Q3A（R2）、制劑雜質研究指導原則 Q3B（R2）些指導原則提及於能夠產強藥理性或毒性潛雜質即使其含量低於0.1%仍建議進行結構鑒定研究修訂版進步明確要關註原料藥潛遺傳毒性雜質及於毒性非強雜質能需要制定更低限度其並未明確闡述遺傳毒性雜質研究控制問題未提具體研究原則、控制策略限度要求
EMA（歐洲藥物評審組織）推《遺傳毒性雜質限度指導原則》, 引入接受風險攝入量即毒性物質限量或稱毒理關註門檻（TTCThreshold of Toxicological Concern）概念設置限度值 TTC(1.5 μg/day)即相於每攝入1.5 μg基毒性雜質認於數藥品說接受風險（致癌風險於十萬）按照閾值根據預期每攝入量計算性藥物接受雜質水平需要指TTC風險管理工具采用概率假基毒性雜質並且我毒性太解每攝