微藻是壹種微型單細胞植物，具有太陽能利用率高、資源豐富、體積小、營養豐富、生長繁殖快、適應性強等優點。
1、改善水質
微藻進行光合作用，光能、水和二氧化碳、無機鹽等可轉化為體內的有機化合物，同時產生大量的氧氣，增加水中溶解氧的含量，並使水體 PH 值升高，促進細菌的礦化作用，細菌在作用下將硫化氫轉化為無毒的硫酸鹽。因此，微藻在改善水質、穩定水體方面發揮著重要作用。目前發現，矽藻凈化廢水效率高，螺旋藻能去除水體中的氨氮，顫藻對磷有較強的吸收能力，矽藻和鞭毛藻不僅能去除氨氮，還能促進對蝦生長。
2、作為餌料生物
微藻含有豐富的蛋白質、大量的礦物質、維生素、氨基酸、核苷酸和生物活性物質等，是維持和促進魚類健康不可缺少的營養物質，因此被廣泛用作水生動物的餌料，是貝類、銀鰱、蝦苗、蟹苗和魚苗的最佳天然餌料。是貝類、銀鰷、蝦苗、蟹苗、魚苗等的最佳天然餌料。此外，微藻蛋白質中的天然免疫物質和生長促進物質是配合飼料無法達到和產生的。微藻作為餌料還能有效控制弧菌的產生。在魚類餌料中添加小球藻可提高魚類的預處理抗性和肉質。在河蟹養殖初期，在河蟹池塘中施用有益微藻，可使池塘水質細嫩清爽，河蟹因易攝食而脫殼成功率大大提高。在沿海貝類池塘中施用有益微藻，可提高蝦、蟹和貝類的產量。
3、增強養殖動物的抗病能力
通過微藻調水，改善養殖環境，可有效提高養殖對象的抗病能力，因此微藻調控是水產生態調控防病的重要組成部分。壹方面，藻類在進行光合作用的同時不僅傳遞氧氣還傳遞熱能，在溫度較高時，病原菌的壽命大大縮短；另壹方面，由於藻類在光合作用過程中消耗了大量的二氧化碳而導致水體的pH值升高，也縮短了病原菌的壽命。利用微藻進行防治要有壹定的連續性，始終使水體中的微藻種類保持壹定的密度，使微藻發揮其作用，達到防病增殖的作用。
四、微藻產品的使用技巧
壹般微藻產品建議在晴天的上午使用，這樣有利於微藻盡快繁殖為水體中的優勢種群，對於瘦弱的水體，可配合使用肥料和底肥，這樣也有利於微藻的繁殖；對於原生動物較多的水體，應先對水體進行殺蟲，三到五次後再進行殺蟲。對於原生動物較多的水體，應先對水體進行殺蟲，三至五次殺蟲後再使用，避免原生動物對微藻的危害；微藻制劑的水體三至五天內不宜使用殺蟲劑和消毒劑，以免影響藻類繁殖；菌藻合用可達到事半功倍的效果，即、與微生態制劑配合使用；最重要的壹點是，微藻要連續使用，必須始終保持壹定的密度，以穩定水質，防止病害，促進藻類生長。最重要的壹點是，微藻的使用應連續進行，始終保持壹定的密度，以達到穩定水質、預防病害、促進生長的目的。