在檢驗中草藥提取物時，必須控制溶劑的濃度(如乙醇等。)按標準來，否則測試結果會大不壹樣。
當中藥制劑溶液(較稠或較少)需要用濾紙過濾時，可先離心分層，再過濾。這樣可以加快過濾速度，減少有機溶劑的揮發(環境溫度高時)。
在制作人參皂苷RB1和黃芪甲苷時，如果同壹實驗室的酸濃度很高，這兩種成分會發生分解，因此無法測定含量，需要避免在酸揮發的同時進行含量預處理。
中藥註射劑的樹脂項檢驗時，最好使用上等氯仿，不同試劑對結果影響較大。同時，提取和放置時間應盡可能長，以使它們完全分離。用HPLC檢測人參和麻黃的含量時，檢測波長為邊緣波長(203 nm，207nm)，往往壹次檢測不成功，特別是使用檢測器壹段時間後。
可以取下色譜柱，直接連接檢測器，用0.1%鹽酸清洗檢測池4小時，效果會更好。在液相中測定中藥含量時，由於每次按標準配制的流動相不同，有時無法分離出峰，可在藥典允許的範圍內適當調整比例，以提高效果。
壹些中藥制劑在低溫提取時，常出現乳化現象，即兩相不易分層。此時可加入少量飽和氯化鈉溶液，或用吹風機加熱分液漏鬥或用熱抹布塗抹，加速其分層。
當液相鑒別中供試品和對照品的出峰時間不壹致，無法判斷是否合格時，可將對照品和供試品混合成混合溶液，再取樣品。如果峰寬沒有變寬，沒有駝峰，則可以判定為合格。
在檢測原料殘留時，如果主藥對雜質有幹擾，現有方法無法檢測，如果需要自建方法，則需要優先通過理化性質分離雜質後再進行測定。
往往會有意想不到的效果。HPLC測定物質的含量時，如果在流動相中使用緩沖鹽，壹定要註意其pH值，在儲存過程中可能會發生變化，有些藥物對這種變化非常敏感。