根據上述職責，河北省衛生廳設14個內設機構： （壹）辦公室。
負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉以及安全保密、政務公開、來信來訪、新聞發布等工作；綜合協調機關政務；負責辦理人大代表建議、政協提案。
（二）人事處。
擬訂全省衛生人力發展規劃和政策草案並指導實施；負責機關和直屬單位的人事管理；會同有關方面擬訂各類衛生專業技術人員資格標準並組織實施；組織指導衛生管理幹部崗位培訓；指導事業單位人事制度改革。
（三）規劃財務處。
擬訂全省衛生事業中長期發展規劃，推動區域衛生規劃工作；統籌規劃與協調全省衛生資源配置，管理大型醫用裝備的配置；提出醫療服務價格、藥品價格、基本醫療保險費用結算等政策的建議；組織擬訂全省衛生裝備管理辦法和標準；擬訂醫療器械采購相關規範並組織實施；負責衛生事業和機關財務管理；負責國有資產管理監督與內部審計；負責全省衛生統計工作；承擔衛生系統信息化建設。
（四）衛生政策法規處（衛生宣傳處）。
組織擬訂全省衛生改革與發展的政策；擬訂全省衛生立法規劃，組織起草地方性衛生法規和規章草案；承擔有關行政復議和行政應訴；承擔機關有關規範性文件的合法性審核；擬訂衛生宣傳規劃，組織開展衛生宣傳。
（五）衛生應急辦公室（突發公***衛生事件應急指揮中心）。
擬訂衛生應急和緊急醫學救援規劃、制度、預案和措施；指導突發公***衛生事件的預防準備、監測預警、處置救援、分析評估等衛生應急活動；指導地方對突發公***衛生事件和其他突發事件實施預防控制及緊急醫學救援；組織實施對突發急性傳染病防控和應急措施；對重大災害、恐怖、中毒事件及核事故、輻射事故等組織實施緊急醫學救援；發布突發公***衛生事件應急處置信息。
（六）疾病預防控制處（河北省愛國衛生運動委員會辦公室、河北省地方病防治領導小組辦公室）。
擬訂全省重大疾病防治規劃、全省免疫規劃和嚴重危害人民健康的公***衛生問題的幹預措施並組織實施，完善重大疾病防控體系，防止和控制疾病的發生和疫情的蔓延；承擔發布法定報告傳染病疫情信息工作；負責省愛國衛生運動委員會和省地方病防治領導小組辦公室的日常工作。
（七）農村與基層衛生管理處。
負責綜合管理農村基本衛生保健和新型農村合作醫療工作，擬訂有關政策、規劃並組織實施；指導全省基層醫療衛生服務體系建設和鄉村醫生相關管理工作；監督指導農村衛生政策的落實；擬訂城市社區衛生改革與發展規劃、相關政策和服務標準，並指導實施；擬訂健康教育、健康促進規劃並指導實施。 （八）婦幼衛生處。
擬訂婦幼衛生工作發展政策、規劃、規範並組織實施；擬訂全省婦幼衛生技術標準並組織實施；對婦幼保健實施監督管理，牽頭組織預防和減少出生缺陷與先天殘疾工作。
（九）醫政處（醫療服務監管處）。
擬訂醫療機構、醫療技術應用、醫療質量和服務、采供血機構管理等有關政策、規範、標準，並組織指導實施；承擔醫療機構醫療服務的監管工作，建立醫療機構質量評價和監督體系，組織開展醫療質量、安全、服務、財務監督和評價等工作；擬訂醫務人員執業標準和服務規範；指導醫院藥事、臨床重點專科建設、醫院感染控制、醫療急救體系建設、臨床實驗室管理等有關工作；參與藥品、醫療器械臨床試驗管理；制訂城市醫療支援農村醫療工作的政策並組織實施；建立健全以公益性為核心的公立醫院監督制度，承擔推進公立醫院管理體制改革工作；負責重大人員傷亡事件組織緊急醫療救援工作。
（十）食品安全綜合協調與衛生監督處。
負責食品安全綜合協調工作；組織擬訂食品安全地方標準，提出食品生產、流通環節的衛生規範和條件，納入食品生產、流通許可的條件；承擔組織查處食品安全重大事故的工作；組織開展食品安全監測、風險評估和預警工作；指導食品安全檢驗工作；承擔重大食品安全信息發布工作；指導規範衛生行政執法工作；按照職責分工，負責職業衛生、放射衛生、環境衛生和學校衛生的監督管理；負責公***場所、飲用水等的衛生監督管理；負責傳染病防治監督；整頓和規範醫療服務市場，組織查處違法行為；督辦重大醫療衛生違法案件。
（十壹）藥物政策與基本藥物制度處。
組織實施國家基本藥物制度，組織擬訂藥品有關地方性法規、規章草案；擬訂藥品采購相關規範並組織實施；組織擬訂全省藥物政策；擬訂全省基本藥物采購、配送、使用的政策措施，會同有關部門提出基本藥物目錄內藥品生產的鼓勵扶持政策；提出全省基本藥物價格政策的建議。
（十二）科技教育處。
擬訂醫藥衛生科技發展規劃；組織實施重點醫藥科研攻關項目；指導醫療衛生方面的技術推廣和科學普及工作；組織實施醫學衛生技術標準；承擔醫藥衛生實驗室生物安全的監督管理；組織指導衛生專業技術崗位的培訓；承擔組織開展繼續醫學教育和畢業後醫學教育；負責指導衛生行業社團的有關工作。
（十三）外事處。
承擔組織指導衛生方面的國際交流合作和衛生援外有關工作；承擔與港澳臺的衛生合作工作。
（十四）幹部保健局。
擬訂並組織實施全省保健工作的政策和規劃；負責省保健對象的醫療保健；承擔重要會議及重大活動的醫療衛生保障；協助開展中央保健對象及重要外賓在河北期間的醫療衛生保障；負責省保健領導小組的日常工作。
機關黨委。負責機關和直屬單位的黨群工作。
離退休幹部處。負責機關離退休幹部工作，指導直屬單位的離退休幹部工作。