制藥工程專業女生就業方向及前景如下：
研發人員——在藥廠、大學、究所的研究部門，從事藥物研發工作。生產、技術人員——在藥廠，從事藥品生產、技術工作。質檢化驗人員——在藥廠、食品廠、藥檢所，從事食品藥品質檢化驗工作。
管理人員——在藥廠，從事藥物的生產技術管理等工作；營銷人員——在藥廠、醫藥營銷公司，從事藥品營銷、內勤等工作。
藥劑師——在醫院藥劑科，從事制劑、質檢、臨床藥學等工作；在藥店、醫藥營銷公司，從事藥品使用指導咨詢等工作。藥檢人員——在藥檢所從事藥物的質量鑒定和制定相應的質量標準。
公司職員——在醫藥貿易公司或制藥企業從事藥品流通及國內外貿易。藥品監督人員——公務員，在國家、省、市、縣藥品監督局，從事食品藥品質量監督等工作；考研——報考生命科學、生物技術、藥學及相關專業的研究生。
制藥工程就業前景分析
醫藥產業已成為世界經濟強國競爭的焦點，世界上許多國家都把建立醫藥品工業視為國家強盛的壹個象征。新藥的不斷發現和治療方法(如基因研究)的巨大進步，促使醫藥工業發生了非常大的變化。
因此，無論是藥品，還是過程技術都需要新型制藥工程師，這類人才掌握最新技術和交叉學科知識、具備制藥過程和產品雙向定位的知識及能力，同時了解密集的工業信息並熟悉全球和本國政策法規。
正如前面已經提到的，2003年中國制藥企業***5082家，生產藥品的工業企業約3000家，生化制藥企業300余家，其中現代生物制藥企業47家。
生產中藥(包括天然藥物)產品的企業約1600家，其中專門生產中藥(包括天然藥物)產品的155家。另外，還有藥品批發企業16.7萬多家，藥品零售企業12萬家，醫療機構6萬家。這些企業都在對制藥工程專業人才有較大的需求量。