抗菌素類
如四環素類藥，可導致骨骼發育障礙，牙齒變黃，先天性白內障等；鏈黴素及卡那黴素，可導致先天性耳聾，並損害腎臟；氯黴素可使骨髓機能受抑制、新生兒肺出血；紅黴素能引起肝損害；磺胺（特別是長效磺胺），可導致新生兒黃疸。
解熱鎮痛藥
阿司匹林或非那西汀，可導致骨骼畸形，神經系統或腎臟畸形。
鎮靜藥
眠爾通，導致發育遲緩、先天性心臟病；安寧片造成發育遲緩；巴比妥類可導致指（趾）短小，鼻孔通聯；氯丙嗪會造成視網膜病變。
激素
雌性激素，造成上肢短缺（海豹樣）、女嬰陰道腺病、男嬰女性化；孕激素，女嬰男性化、男嬰尿道下裂；考地松，無腦兒、兔唇腭裂、低體重畸形；甲狀腺素也會引起畸形。
抗腫瘤藥
環磷酰胺，可致四肢短缺、外耳缺損、腭裂；6－硫嘌呤，可致腦積水、腦脊膜膨出、唇裂、腭裂。
中藥
麝香、斑蟊、水蛭、虻蟲、商陸、巴豆、牽牛、三棱、莪術，致畸、流產、死胎。鑒於藥物有時能致畸，因此，懷孕初期最好不要有壹點小病就服藥。當然，也不是說得了什麽病都不服藥，切記要在醫生指導下用藥，應選擇對胎兒無害的藥物。如果因病情需要必須服用某種藥物，又是在致畸的敏感期使用有害藥物，為了胎兒的健康、聰明，最好先給孕婦治病，然後再做人工流產，為將來懷孕保護身體。
千萬不要盲目保胎，也不要聽信什麽“偏方”、“秘方”，以免對胎兒造成更大的危害。另外，如需服用中藥時，可遵醫囑或按藥品服用說明來執行。
其他藥物
對於那些已出現停經，但因故未去檢查是否妊娠，並堅持吃避孕藥的婦女來說，如果醫生診斷已確定懷孕，就應該做流產手術。因在妊娠初期仍服避孕藥而自然流產的胎兒中，染色體不正常的占總數的48％。同時，那些自然流產的胎兒還帶有某種缺陷，這都是避孕藥物的作用。有些胎兒患先天性心臟病及肢體短缺，常與母親盲目服用避孕藥有關。若要再次懷孕必須等停藥後（人工流產或自然流產）滿6個月，方可再懷孕。有壹些藥物雖然不是通過口服進入體內，但長期在農藥庫工作或在有毒的化工車間工作的婦女，孕期壹定要調離對胎兒產生不利影響的環境，避免藥物中毒而對胎兒造成難以彌補的損傷。另外，煤氣中毒也會危害胎兒。