藥物安全性存在差異。
紫杉醇:親脂性強，不溶於水，需要在紫杉醇註射液中加入聚氧乙烯蓖麻油和無水乙醇進行溶解。聚乙氧基乙基蓖麻油可引起不同程度的過敏反應，加重紫杉醇的外周神經毒性，還可影響藥物分子向組織的擴散，從而影響抗腫瘤效果。發現聚氧乙烯蓖麻油能溶解PVC輸液器中的鄰苯二甲酸二乙烯酯，引起嚴重不良反應。
多西他賽:水溶性低，必須加入聚山梨酯80和無水乙醇幫助溶解，兩者均可增加不良反應的發生。乙醇能抑制中樞神經系統，通過人體紅細胞膜引起紅細胞變性或溶血；聚山梨酯80為非離子表面活性劑，可引起過敏反應和溶血反應。
白蛋白結合型紫杉醇:無需添加助溶劑聚氧乙烯蓖麻油，可安全增加紫杉醇劑量，縮短滴註時間，無需預處理。
紫杉醇脂質體:改變了紫杉醇的溶媒，避免了聚氧乙烯蓖麻油帶來的毒副作用。據報道，紫杉醇脂質體靜脈給藥的最大耐受量可達200 mg/kg，而紫杉醇註射液僅為30 mg/kg。紫杉醇脂質體對動物的毒性明顯小於紫杉醇註射液。
預處理不壹樣。
紫杉醇:為防止過敏反應，紫杉醇治療前12小時和6小時口服地塞米松20 mg，治療前30 ~ 60分鐘肌肉註射苯海拉明50 mg，靜脈註射西咪替丁300 mg或雷尼替丁50 mg。
多西他賽:為了減少液體瀦留的發生和嚴重程度以及過敏反應的嚴重程度，所有患者在接受多西他賽治療前必須服用糖皮質激素。地塞米松通常在多西他賽給藥前壹天服用，每次8 mg，每天兩次，共3天。
白蛋白結合的紫杉醇在給藥前不需要預處理來防止過敏反應。
紫杉醇脂質體:為防止紫杉醇可能出現的過敏反應，在紫杉醇脂質體治療前30分鐘給予預處理，靜脈註射地塞米松5 ~ 10mg；肌肉註射苯海拉明50毫克；靜脈註射西咪替丁300毫克。
不良反應不壹樣。
紅豆杉類藥物的不良反應也差不多，通常包括過敏反應、骨髓抑制、神經毒性、心血管毒性、關節肌肉疼痛、胃腸道反應、肝毒性、脫發等。
紫杉醇註射液:獨特的不良反應是對聚氧乙烯蓖麻油的過敏反應。
多西他賽:獨特的不良反應是液體瀦留。此外，多西紫杉醇引起的中性粒細胞減少與紫杉醇引起的不同，白細胞減少是劑量依賴性而非時間依賴性。
白蛋白結合型紫杉醇和紫杉醇脂質體:由於制備工藝的改進，不再需要添加聚氧乙烯蓖麻油、聚山梨酯80、無水乙醇等輔料，用藥安全性大大提高。
適應癥有差異。
紫杉醇:適用於晚期卵巢癌的壹線及後續治療，阿黴素標準化療後淋巴結陽性乳腺癌的輔助治療，聯合化療失敗或輔助化療後半年內復發的乳腺癌伴轉移性乳腺癌，非小細胞肺癌的壹線治療，艾滋病相關肉瘤的二線治療。
多西紫杉醇:適用於局部晚期或轉移性乳腺癌，局部晚期或轉移性非小細胞肺癌，激素難治性轉移性前列腺癌，以及以前未接受過化療的晚期胃腺癌(包括胃食管結合部腺癌)。
白蛋白結合型紫杉醇:根據相關文獻，其單藥及聯合方案是進展迅速或多線治療失敗的難治性晚期乳腺癌的治療選擇，對既往治療的紫杉醇及晚期三陰乳腺癌也有壹定療效，且毒副作用可耐受。
紫杉醇脂質體:文獻報道紫杉醇在乳腺癌、非小細胞肺癌、卵巢癌的療效與紫杉醇相當，安全性相對更高。對於不能耐受紫杉醇註射液的患者，可以考慮改用紫杉醇脂質體進壹步治療。