OIE規定，合格的豬口蹄疫疫苗應具有3PD50/頭份，而我國目前制備的口蹄疫合成肽疫苗每頭份的疫苗抗原含量大於3PD50，據中國獸醫藥品監察所檢驗報告顯示，目前批號為豬口蹄疫合成肽疫苗的O型抗原含量大於10PD50/頭份。大於 10 PD50/頭，遠遠超過國際標準。根據疫苗生產廠家的效價試驗，豬O型口蹄疫合成肽疫苗免疫壹次後的第6個月，仍能抵抗200MID/頭OR/80MF8強毒的攻擊，達到100%的保護率，第壹次免疫28d後再加強免疫壹次，免疫8個月後再進行攻擊試驗，對豬仍有很強的保護作用，保護率達到100%。這也證明了豬口蹄疫O型合成肽疫苗具有良好的免疫效果，優於滅活疫苗。
二、免疫持續時間長
豬用豬O型口蹄疫合成肽疫苗免疫後，用VP1-ELISA試驗進行免疫持續時間檢測，21天70%以上的樣品呈陽性，2周後二免，100%陽性，且抗體水平普遍很高；二免後1個月、2個月、3個月、4個月直至豬出欄，采血。在檢測免疫抗體時，抗體陽性率壹直保持在較高的範圍內。這表明，與滅活疫苗相比，合成肽疫苗加強免疫後免疫抗體的陽性率大大提高，同時也證明了其免疫時間比滅活疫苗更長。在我國實行春秋兩季防疫的前提下，豬口蹄疫O型的防控顯得意義重大。
三、疫苗制備抗原的廣譜性
豬O型口蹄疫合成肽疫苗設計的抗原序列涵蓋了多種O型毒株的抗原位點序列，因此抗原位點具有更廣泛的廣譜性，能有效抵抗多種流行O型毒株的侵襲。我國獸醫工作者曾用豬O型口蹄疫（FMD）流行株OR/80MF8、OGD/95MF8和OS/99MF8合成肽疫苗對豬進行免疫攻擊、試驗結果表明，該疫苗對OGD/95MF8和OS/99MF8毒株具有良好的保護作用，保護率分別為100%（5/5）和80%（4/5），對OR/80MF8毒株的合並感染也有抵抗力（保護率為5/5）。
第四，免疫抗體水平與保護力之間存在相關性
雖然滅活疫苗免疫後抗體水平與保護力之間存在壹定的相關性，但這種關系並不十分明確。臨床試驗證明，滅活疫苗免疫後，檢測出免疫抗體不壹定存在保護力，檢測出免疫抗體也能產生壹定的保護力，這是豬 O 型口蹄疫防控過程中的壹個難點、不能有效評價滅活疫苗免疫力的好壞，這可能是由於口蹄疫的免疫機制中除了體液免疫外，細胞免疫也是非常重要的壹環，這可能是由於口蹄疫的免疫機制中除了體液免疫外，細胞免疫也是非常重要的壹環。通過有關疫苗生產廠家的免疫後攻擊實驗表明，豬O型口蹄疫合成肽疫苗免疫後，免疫抗體在≥25的範圍內，對強病毒攻擊的保護率達到95%以上，所以可以通過抗體檢測來評價免疫密度和免疫質量。
五是疫苗免疫抗體和感染抗體易於鑒別
我國口蹄疫防控現狀復雜，免疫抗體和感染抗體（NS抗體）的鑒別診斷已成為防控工作的重要組成部分。在使用豬 O 型口蹄疫合成肽疫苗防控口蹄疫的過程中，由於該疫苗采用 VPl 中的壹段肽作為抗原，不含 NS 蛋白，其產生的免疫抗體不會與 NS 蛋白產生的抗體相混淆，因此在檢測過程中不會影響野毒感染產生的 NS 抗體，免疫抗體與感染抗體可通過口蹄疫 NS（3ABC）ELISA 檢測進行鑒別。采用口蹄疫 NS（3ABC）ELISA 檢測方法可將免疫抗體與感染抗體區分開來。
六、過敏反應低
豬O型口蹄疫滅活疫苗免疫後常出現食欲不振、嘔吐、體溫升高等不良反應，有時還可引起懷孕母豬接種後流產、早產等，過敏反應的直接原因是全病毒疫苗由於生產工藝和佐劑等因素，疫苗中存在細胞碎片、血清等異體蛋白，機體對其產生反應。疫苗中的異體蛋白，機體對其產生過敏反應。但豬O型口蹄疫合成肽疫苗的抗原不是滅活的口蹄疫全病毒，在生產過程中不需要經過滅活劑滅活，而是采用高純度的化學合成肽作為抗原，抗原單壹，不存在細胞碎片、血清等外來蛋白，因此可以有效避免外來蛋白引發的過敏反應。臨床實踐也證明，註射豬 O 型合成肽疫苗後，免疫豬的過敏反應低於滅活疫苗免疫豬。
七、疫苗質量穩定
滅活疫苗在制備過程中，不能消除酶的影響，導致疫苗中的病毒逐漸裂解，免疫效力逐漸降低，隨著疫苗保存時間的延長，免疫原性大幅度下降。相比之下，合成多肽疫苗制備過程中抗原的合成和細胞位點的組合采用世界上最先進的數控技術，抗原含量精確穩定，消除了酶對疫苗的影響。根據疫苗生產廠家的穩定性試驗，該疫苗在 2℃～8℃條件下保存 12 個月後，按標準劑量對豬進行免疫接種，28d 後可抵抗 200MID 強毒的攻擊，保護率高達 100%。由此可見，豬O型合成肽疫苗的質量比滅活疫苗更穩定。
雖然豬O型口蹄疫合成肽疫苗克服了滅活疫苗的壹些缺陷，具有滅活疫苗無法比擬的優點。但也存在壹些不足，如缺乏天然蛋白質的三維結構，分子量小，不能獲得足夠的免疫原性，難以像蛋白質抗原那樣誘導機體的多種免疫應答，而且多肽疫苗的半衰期短，同時缺乏足夠的B細胞抗原表位的刺激，B細胞和T細胞抗原表位難以發揮協同作用。不過，隨著生物技術的不斷發展，人們對口蹄疫病毒的特性、免疫應答機制會有更深入的了解，豬口蹄疫合成肽疫苗也會有所突破，更加完善，為我國口蹄疫的防控提供保障。