《傷寒論》最初將便秘分為“陽結”和“陰結”，但後世發揮了作用。例如，張說:“臟腑的秘密不能籠統地對待。有虛秘，有風秘，有氣秘，有冷秘，有熱秘……”張景嶽認為“這五秘的名稱過於復雜，毫無根據，無法自圓其說，卻又混淆不清，並非沒有臨床危害。不知道這張牌的鑒別器是不是二，所以叫陰。他極力主張根據仲景法將便秘分為陽結和陰結兩類。李東垣還強調了腎陰虛在本病發病中的作用。《藍室秘集》說:“腎主大便，排便困難者，宜取足少陰。丈夫腎主五液，津液潤澤，大便正常。餓了就會勞累過度，損傷腸胃，吃辣、熱、稠的食物，有助於上火，會淹沒在血液中，消散真陰，津液不足，所以大便幹燥。沈驥還強調，“便秘和腎病也是壹樣的。”。“後來，我們通常把它分為兩類:真實秘密和虛擬秘密。
實秘(陽結)是指胃腸燥熱引起的便秘，分為熱秘和氣秘兩種。
熱秘——胃腸道燥熱引起的便秘稱為熱秘。癥見大便硬，面赤心煩，赤熱面赤，口幹口臭，脘腹脹痛，舌質紅，苔黃燥，脈滑。
治療應該是清熱潤腸。如果此證具有陽明腑證的全部主要癥狀，可以用《傷寒論》的逐承氣湯或三黃湯(片)治療，然後再用壹個緩效方子治療，如麻子仁丸。若傷津液，則加生地、玄參、石斛。
氣秘——肝脾氣滯，大腸傳導失職引起的便秘稱為氣秘。癥狀包括便秘，經常打嗝，胸脅脹滿，腹痛少，食欲不振，苔薄膩，脈細。
治療氣滯，主方選用劉墨湯(沈香、烏藥、檳榔、大黃、枳殼、人參)。此方多為芳香類藥物，可止中證正氣之傷。若氣滯化火日久，癥見口苦、咽幹、苔黃，可加牡丹皮、梔子、龍膽草。
虛秘(陰結)指脾腎兩虛引起的便秘。便秘可分為氣虛、陰虛、陽虛。
氣虛便秘——肺脾兩虛，大腸傳導無力引起的便秘稱為氣虛便秘。癥狀是大便不壹定幹硬，雖然很容易，但是很難賺到疲勞，甚至是氣短面色蒼白。白色，大便後精神疲乏，舌淡苔白，脈沈，無力。
對黃芪湯(黃芪、魚腥草、赤芍、牡丹皮、桔梗、瓜蔞、大黃)的處方進行了修改。如果氣虛明顯，可加入黨參、白術等補氣。
陰虛便秘——因幹燥、津液不足、大腸失濕而引起的便秘稱為陰虛便秘。癥狀有便秘、難賺、似羊糞、頭暈心悸、飲後不解渴、舌紅苔黃幹或無苔、脈沈細等。
宜滋陰養血潤燥，方劑為潤腸丸、增液湯。如果被血虛陰虛、口幹、津液不足所煩，可以加加拿大人參、何首烏。此證類似於經驗熱秘，臨床上應靈活掌握“急則治標，緩則治本”的原則。
陽虛便秘——脾腎陽虛、陰寒凝滯、大腸傳導阻滯所致的便秘稱為陽虛便秘。癥狀包括大便困難，小便長，面色蒼白。白，肢體低溫，小腹冷痛，背部酸冷，惡熱惡寒，舌淡苔白，脈緩。
溫陽治便秘，可選用濟川湯加減，也可選用半硫丸溫散寒凝，開合結。
總之，便秘的治療壹定要分虛實。實證是燥熱氣滯引起的便秘，虛證不同於氣虛、陰虛、陽虛。燥熱者宜清熱攻毒，停滯者宜順氣導滯；氣虛者宜益氣潤腸，陰虛者宜養血潤燥，陽虛者宜溫陽通便。以上證型在臨床上有時單獨出現，有時合並出現，治療方法也要靈活運用。比如氣虛陰虛、氣虛陽虛引起的便秘，往往可以壹起看。臨床上宜根據虛的程度分別采用益氣養血、益溫陽之法，不能完全通便。