藥物治療有助於恢復患者的竇性心律和心室率，同時可預防血栓栓塞。房顫首次發作，臨床課用普羅帕酮或氟卡胺。若房顫持續2天以上7天以下，可靜脈註射氟卡胺、多非替帕克榮蘇、普羅帕酮、布洛芬等藥物，治愈率可達50%。如果房顫發作超過7天，藥物治療的效果就會大打折扣。壹般可以用以下藥物來改善，如胺碘酮、伊布樸容素、多芬樸容素等。
除了上述藥物外，還有壹種藥物可以幫助控制心室率，有助於維持心臟功能，減少房顫引起的心臟功能障礙。這類藥物主要包括以下幾種:
1，β受體阻滯劑:臨床廣泛使用的藥物，可以單獨使用。
2.鈣通道拮抗劑:維拉帕米和地爾硫卓較為常見，有助於控制心室率，可與地高辛聯用或單獨使用。主要用於治療無器質性心臟病、左心室收縮功能正常和慢性阻塞性肺疾病的患者。
3.洋地黃:在緊急情況下可用於控制心房顫動和心室率，適用於左心衰竭時控制心室率。
4.胺碘酮:在房顫發作時有助於控制心室率，但不適合長期治療慢性房顫和心室率。壹般在其他藥物失效或不能使用時使用這些藥物，心力衰竭患者需要緊急治療時使用。