1.外科切除
當損傷在凹凸不平的特殊部位或浸潤性潰瘍較深，不適合其他治療時，可做手術切除植皮。
2.x射線照射
基底細胞癌對輻射敏感，無痛，患者願意接受，最適合老年人。
3.電烙術
對於早期的小基底細胞癌，可以用電灼將其完全燒傷，但愈合後會留下疤痕。
4.銳匙刮除術
據悉，采用銳匙刮治法治療基底細胞癌，5年以上未復發，美容效果極佳。
5.液氮冷凍
液氮達到-195℃時具有極佳的破壞作用，液氮冷凍治療可用於小面積基底細胞癌。大面積的基底細胞癌也可以做冷凍治療，但愈合時間較長。
6.激光療法
有人曾采取二氧化碳激光治療基底細胞癌，取得了極好的效果。愈合快，術後疼痛少，但會留下疤痕。
7.外用細胞毒性藥物治療
常用於治療基底細胞癌的細胞毒藥物是5%氟尿嘧啶，可以完全破壞基底細胞癌，但服藥非常痛苦，而且勢必會引起紅腫等刺激。
8.新方法
雖然(1)維a酸類藥物有不良反應，需要長期治療，但用維a酸類藥物治療多發性基底細胞癌患者是有前途的。
(2)免疫療法最近有很多報道，幹擾素α-2a作為局部註射免疫療法治療基底細胞癌。
(3)光動力療法光動力療法是用血卟啉衍生物或雙血卟啉，再用可調染料激光(波長為630nm)照射全身。對基底細胞癌的治療有很好的效果。腫瘤的部分和完全根治率分別為44%和82%，主要不良反應為光敏性。
(4)化療局部外用氟尿嘧啶可成功治療多發性淺表基底細胞癌，並可防止其復發。全身化療藥物用於治療大的侵襲性非轉移性基底細胞癌。順鉑和阿黴素聯合放療或不放療是最有效的。博萊黴素治療也有不同的療效。