肛周膿腫即使形成肛瘺也比較容易治療；如果延誤了膿腫的早期手術治療，感染病竈很可能轉移到周圍間隙，形成大面積膿腫。膿液可從皮下擴散至坐骨直腸窩，通過組織間隙從患側擴散至對側，也可通過內外括約肌進入肛門，向上穿透肛提肌進入盆腔形成腹膜炎。或向直腸、膀胱、陰道、尿道等鄰近組織器官擴散，形成各種類型的復雜肛瘺。
肛周膿腫或肛瘺五年以上可誘發肛周膿腫癌變。因為肛周膿腫的發展會經歷壹個由淺入深、由輕入重的過程，首先表現為肛門疼痛，然後疼痛加劇，形成位置更深更廣的膿腫。患者常發熱惡寒，壹旦肛周膿腫破裂，就會形成肛瘺。
肛周膿腫壹般不會自愈。壹旦發現膿腫，要及時就醫。少數肛周膿腫可通過抗生素、熱水坐浴、局部理療等方法消散，但多數需要手術治療，手術方法根據膿腫部位不同而不同，越早越好。
輕度肛周膿腫可保守治療，具體為局部用藥+肛門護理+改善不良生活習慣。如果惡化，可能會導致肛瘺等更嚴重的問題，需要嚴肅處理。
大多數人會遵醫囑使用藥物，比如高錳酸鉀，但大多數人往往缺乏和忽視的是肛門護理，具體來說就是排便後沖洗、坐位、熏蒸、坐浴，保證每天壹次20分鐘的療程(妳肯定沒有做到，這是腫塊不消失、膿腫復發的根本原因)。
然而，做到這壹點並不容易。需要準備壹個肛腸康復包，裏面有壹個手持的洗漱衣，幫助排便後清潔(以保證排便後的清潔)，壹個肛門水療儀，幫助放在馬桶上熏蒸洗澡，促進水腫消退(蹲在地上壹般需要幾分鐘，不發揮藥物的作用)， 以及幫助懸空傷口促進愈合的無痛透氣墊(這個特別重要，壹是因為摩擦壓力大容易破，二是傷口很難氣密)。