判斷方法如下:
1.真菌通常呈亮白色，緊緊附著在龜殼上，由壹點或幾點向四周擴散，逐漸成為壹片。蘇打水的白色不是很亮，但是在龜殼上有凸起感和粗糙感，壹般是成片出現。
2.木耳在岸邊是亮白色的，剛入水還沒有變化，還能看到明顯的白色。水堿在岸上也是白色的，但是壹入水就會變，白色會褪色，甚至根本看不到白色。
3.水堿類似水垢，屬於堿性物質，遇酸會中和。真菌遇酸不會發生變化。所以，可以用牙刷蘸醋來刷。能刷掉的是水和堿，沒變的是真菌。
真菌的處理:
1.被真菌感染的龜應立即隔離飼養，否則會感染其他健康的龜。水龜或半水龜建議保持幹燥，隔離環境要保證通風、日曬、幹燥。
2.拋光覆蓋物，並用手術刀片背面拋光真菌感染產物。真菌斑比較頑固，打磨起來很費力氣，經常會刮傷後面的指甲。
3.使用抗真菌藥物，如達克寧軟膏，均勻塗於患處，1-2次，每日1次。壹般需要三個月才能看到療效。如果真菌感染嚴重，需要全身應用抗真菌藥物。
4.每天給甲魚洗澡2-3次，每次20分鐘左右，用5%聚維酮碘溶液溶解於水中，藥水比為1: 500-1000。用藥水浸泡烏龜的目的是烏龜洗澡時會喝藥水，以達到治療效果。
水-堿處理方法:
用法:用食醋去除龜殼中的水分和堿。操作方法:用牙刷蘸取適量食醋，然後用水和堿順時針或逆時針反復刷洗部位，最後用清水沖洗甲魚身上的臟汁。龜甲完全幹透後，檢查壹下。如果有水堿，可以用上述方法反復刷幾遍，直到水堿完全去除。用新牙刷(舊牙刷的毛已經掉下來了，刷牙效果差)。如果是幼苗，選擇較軟的牙刷，最好是尖毛的軟毛牙刷。