2.囊腫減壓:該手術減輕了囊腫對腎實質的壓力，保護了大部分殘存腎單位不受擠壓和進壹步損害，改善了腎缺血，恢復了部分腎功能單位，延緩了病情發展。手術成功的關鍵是盡早手術，囊腫減壓必須徹底，小囊腫和深部囊腫的減壓不能放棄。兩邊都要手術，兩邊手術間隔壹般半年以上。在晚期病例中，如果氮質血癥和尿毒癥時腎功能已經受損，無論有無高血壓，減壓治療都沒有意義，手術發作可加重病情。
3.透析移植:當進入終末期腎衰竭時，應立即進行透析治療，首選血液透析。多囊腎患者腎移植存活率與其他原因患者相似，但並發疾病增加了術後處理難度，影響移植效果。
4.中醫治療:目前中醫治療會以中醫的“陰陽平衡”為基礎，通過修復受損的腎臟細胞來有效治療多囊腎。